Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
SHANK2Q9UPX8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
SHANK2Q9UPX8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
SHANK2Q9UPX8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
SHANK2Q9UPX8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
SHANK2Q9UPX8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
SHANK2Q9UPX8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
SHANK2Q9UPX8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
SHANK2Q9UPX8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
SHANK2Q9UPX8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
SHANK2Q9UPX8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
SHANK2Q9UPX8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC38.52■■■■□ 3.76
SHANK2Q9UPX8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
SHANK2Q9UPX8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
SHANK2Q9UPX8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
SHANK2Q9UPX8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
SHANK2Q9UPX8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
SHANK2Q9UPX8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
SHANK2Q9UPX8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC38.49■■■■□ 3.75
SHANK2Q9UPX8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
SHANK2Q9UPX8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
SHANK2Q9UPX8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
SHANK2Q9UPX8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
SHANK2Q9UPX8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
SHANK2Q9UPX8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
SHANK2Q9UPX8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
SHANK2Q9UPX8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
SHANK2Q9UPX8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC38.44■■■■□ 3.74
SHANK2Q9UPX8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
SHANK2Q9UPX8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
SHANK2Q9UPX8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
SHANK2Q9UPX8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
SHANK2Q9UPX8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
SHANK2Q9UPX8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
SHANK2Q9UPX8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
SHANK2Q9UPX8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
SHANK2Q9UPX8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
SHANK2Q9UPX8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
SHANK2Q9UPX8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
SHANK2Q9UPX8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
SHANK2Q9UPX8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
SHANK2Q9UPX8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
SHANK2Q9UPX8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
SHANK2Q9UPX8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
SHANK2Q9UPX8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC38.37■■■■□ 3.73
SHANK2Q9UPX8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
SHANK2Q9UPX8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
SHANK2Q9UPX8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
SHANK2Q9UPX8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
SHANK2Q9UPX8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
SHANK2Q9UPX8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
SHANK2Q9UPX8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
SHANK2Q9UPX8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
SHANK2Q9UPX8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
SHANK2Q9UPX8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC38.33■■■■□ 3.73
SHANK2Q9UPX8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
SHANK2Q9UPX8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
SHANK2Q9UPX8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
SHANK2Q9UPX8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
SHANK2Q9UPX8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
SHANK2Q9UPX8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.72
SHANK2Q9UPX8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
SHANK2Q9UPX8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
SHANK2Q9UPX8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
SHANK2Q9UPX8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
SHANK2Q9UPX8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
SHANK2Q9UPX8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
SHANK2Q9UPX8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
SHANK2Q9UPX8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
SHANK2Q9UPX8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
SHANK2Q9UPX8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
SHANK2Q9UPX8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
SHANK2Q9UPX8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
SHANK2Q9UPX8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
SHANK2Q9UPX8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
SHANK2Q9UPX8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
SHANK2Q9UPX8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
SHANK2Q9UPX8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
SHANK2Q9UPX8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
SHANK2Q9UPX8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
SHANK2Q9UPX8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
SHANK2Q9UPX8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
SHANK2Q9UPX8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
SHANK2Q9UPX8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
SHANK2Q9UPX8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
SHANK2Q9UPX8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC38.2■■■■□ 3.71
SHANK2Q9UPX8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
SHANK2Q9UPX8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
SHANK2Q9UPX8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
SHANK2Q9UPX8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
SHANK2Q9UPX8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC38.19■■■■□ 3.7
SHANK2Q9UPX8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
SHANK2Q9UPX8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
SHANK2Q9UPX8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
SHANK2Q9UPX8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
SHANK2Q9UPX8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
SHANK2Q9UPX8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
SHANK2Q9UPX8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
SHANK2Q9UPX8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
SHANK2Q9UPX8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms