Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMG5Q9UPR3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SMG5Q9UPR3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMG5Q9UPR3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMG5Q9UPR3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMG5Q9UPR3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMG5Q9UPR3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMG5Q9UPR3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMG5Q9UPR3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMG5Q9UPR3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMG5Q9UPR3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMG5Q9UPR3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMG5Q9UPR3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMG5Q9UPR3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMG5Q9UPR3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMG5Q9UPR3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMG5Q9UPR3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMG5Q9UPR3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMG5Q9UPR3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMG5Q9UPR3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMG5Q9UPR3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMG5Q9UPR3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMG5Q9UPR3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMG5Q9UPR3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMG5Q9UPR3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMG5Q9UPR3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMG5Q9UPR3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMG5Q9UPR3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMG5Q9UPR3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMG5Q9UPR3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMG5Q9UPR3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMG5Q9UPR3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMG5Q9UPR3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMG5Q9UPR3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMG5Q9UPR3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMG5Q9UPR3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SMG5Q9UPR3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMG5Q9UPR3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMG5Q9UPR3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SMG5Q9UPR3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMG5Q9UPR3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMG5Q9UPR3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMG5Q9UPR3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SMG5Q9UPR3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMG5Q9UPR3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMG5Q9UPR3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMG5Q9UPR3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMG5Q9UPR3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMG5Q9UPR3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMG5Q9UPR3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMG5Q9UPR3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMG5Q9UPR3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMG5Q9UPR3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SMG5Q9UPR3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMG5Q9UPR3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMG5Q9UPR3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMG5Q9UPR3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMG5Q9UPR3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SMG5Q9UPR3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SMG5Q9UPR3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMG5Q9UPR3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMG5Q9UPR3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMG5Q9UPR3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMG5Q9UPR3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMG5Q9UPR3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMG5Q9UPR3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMG5Q9UPR3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMG5Q9UPR3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMG5Q9UPR3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMG5Q9UPR3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SMG5Q9UPR3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMG5Q9UPR3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMG5Q9UPR3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMG5Q9UPR3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMG5Q9UPR3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMG5Q9UPR3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMG5Q9UPR3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMG5Q9UPR3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMG5Q9UPR3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMG5Q9UPR3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMG5Q9UPR3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMG5Q9UPR3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMG5Q9UPR3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMG5Q9UPR3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMG5Q9UPR3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMG5Q9UPR3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMG5Q9UPR3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMG5Q9UPR3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMG5Q9UPR3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMG5Q9UPR3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMG5Q9UPR3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMG5Q9UPR3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMG5Q9UPR3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMG5Q9UPR3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMG5Q9UPR3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMG5Q9UPR3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMG5Q9UPR3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMG5Q9UPR3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMG5Q9UPR3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMG5Q9UPR3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms