Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMCC3Q9ULS5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMCC3Q9ULS5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMCC3Q9ULS5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMCC3Q9ULS5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMCC3Q9ULS5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMCC3Q9ULS5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMCC3Q9ULS5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMCC3Q9ULS5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMCC3Q9ULS5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMCC3Q9ULS5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMCC3Q9ULS5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TMCC3Q9ULS5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMCC3Q9ULS5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMCC3Q9ULS5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMCC3Q9ULS5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMCC3Q9ULS5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMCC3Q9ULS5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMCC3Q9ULS5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMCC3Q9ULS5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMCC3Q9ULS5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMCC3Q9ULS5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMCC3Q9ULS5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMCC3Q9ULS5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMCC3Q9ULS5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMCC3Q9ULS5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMCC3Q9ULS5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMCC3Q9ULS5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMCC3Q9ULS5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMCC3Q9ULS5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMCC3Q9ULS5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMCC3Q9ULS5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TMCC3Q9ULS5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMCC3Q9ULS5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMCC3Q9ULS5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMCC3Q9ULS5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMCC3Q9ULS5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMCC3Q9ULS5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMCC3Q9ULS5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMCC3Q9ULS5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMCC3Q9ULS5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMCC3Q9ULS5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMCC3Q9ULS5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCC3Q9ULS5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCC3Q9ULS5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCC3Q9ULS5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCC3Q9ULS5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCC3Q9ULS5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCC3Q9ULS5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCC3Q9ULS5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCC3Q9ULS5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCC3Q9ULS5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCC3Q9ULS5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCC3Q9ULS5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCC3Q9ULS5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMCC3Q9ULS5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMCC3Q9ULS5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMCC3Q9ULS5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TMCC3Q9ULS5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMCC3Q9ULS5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMCC3Q9ULS5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMCC3Q9ULS5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TMCC3Q9ULS5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMCC3Q9ULS5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMCC3Q9ULS5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMCC3Q9ULS5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMCC3Q9ULS5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMCC3Q9ULS5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMCC3Q9ULS5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMCC3Q9ULS5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMCC3Q9ULS5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMCC3Q9ULS5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMCC3Q9ULS5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMCC3Q9ULS5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMCC3Q9ULS5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMCC3Q9ULS5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMCC3Q9ULS5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMCC3Q9ULS5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMCC3Q9ULS5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMCC3Q9ULS5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMCC3Q9ULS5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMCC3Q9ULS5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMCC3Q9ULS5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMCC3Q9ULS5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMCC3Q9ULS5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMCC3Q9ULS5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMCC3Q9ULS5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMCC3Q9ULS5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMCC3Q9ULS5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMCC3Q9ULS5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TMCC3Q9ULS5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMCC3Q9ULS5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMCC3Q9ULS5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMCC3Q9ULS5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMCC3Q9ULS5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMCC3Q9ULS5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMCC3Q9ULS5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMCC3Q9ULS5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMCC3Q9ULS5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMCC3Q9ULS5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms