Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PADI1Q9ULC6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PADI1Q9ULC6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PADI1Q9ULC6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PADI1Q9ULC6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PADI1Q9ULC6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PADI1Q9ULC6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PADI1Q9ULC6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PADI1Q9ULC6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PADI1Q9ULC6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PADI1Q9ULC6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PADI1Q9ULC6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PADI1Q9ULC6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PADI1Q9ULC6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PADI1Q9ULC6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PADI1Q9ULC6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PADI1Q9ULC6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PADI1Q9ULC6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PADI1Q9ULC6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PADI1Q9ULC6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PADI1Q9ULC6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PADI1Q9ULC6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PADI1Q9ULC6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PADI1Q9ULC6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PADI1Q9ULC6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PADI1Q9ULC6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PADI1Q9ULC6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PADI1Q9ULC6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PADI1Q9ULC6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PADI1Q9ULC6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PADI1Q9ULC6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PADI1Q9ULC6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PADI1Q9ULC6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PADI1Q9ULC6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PADI1Q9ULC6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PADI1Q9ULC6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PADI1Q9ULC6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PADI1Q9ULC6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PADI1Q9ULC6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PADI1Q9ULC6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PADI1Q9ULC6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PADI1Q9ULC6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PADI1Q9ULC6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PADI1Q9ULC6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PADI1Q9ULC6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PADI1Q9ULC6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PADI1Q9ULC6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PADI1Q9ULC6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PADI1Q9ULC6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PADI1Q9ULC6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PADI1Q9ULC6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PADI1Q9ULC6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PADI1Q9ULC6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PADI1Q9ULC6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PADI1Q9ULC6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PADI1Q9ULC6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PADI1Q9ULC6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PADI1Q9ULC6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PADI1Q9ULC6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PADI1Q9ULC6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PADI1Q9ULC6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PADI1Q9ULC6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PADI1Q9ULC6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PADI1Q9ULC6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PADI1Q9ULC6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PADI1Q9ULC6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PADI1Q9ULC6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PADI1Q9ULC6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PADI1Q9ULC6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PADI1Q9ULC6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PADI1Q9ULC6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PADI1Q9ULC6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PADI1Q9ULC6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PADI1Q9ULC6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PADI1Q9ULC6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PADI1Q9ULC6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PADI1Q9ULC6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PADI1Q9ULC6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PADI1Q9ULC6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PADI1Q9ULC6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PADI1Q9ULC6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PADI1Q9ULC6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PADI1Q9ULC6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PADI1Q9ULC6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PADI1Q9ULC6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PADI1Q9ULC6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PADI1Q9ULC6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PADI1Q9ULC6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PADI1Q9ULC6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PADI1Q9ULC6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PADI1Q9ULC6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PADI1Q9ULC6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PADI1Q9ULC6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PADI1Q9ULC6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PADI1Q9ULC6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PADI1Q9ULC6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PADI1Q9ULC6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PADI1Q9ULC6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PADI1Q9ULC6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PADI1Q9ULC6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.6 ms