Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV9

DDX41, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX41, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX41Q9UJV9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDX41Q9UJV9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDX41Q9UJV9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDX41Q9UJV9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDX41Q9UJV9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DDX41Q9UJV9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DDX41Q9UJV9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DDX41Q9UJV9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DDX41Q9UJV9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DDX41Q9UJV9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DDX41Q9UJV9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DDX41Q9UJV9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DDX41Q9UJV9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DDX41Q9UJV9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DDX41Q9UJV9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DDX41Q9UJV9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DDX41Q9UJV9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DDX41Q9UJV9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
DDX41Q9UJV9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DDX41Q9UJV9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DDX41Q9UJV9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DDX41Q9UJV9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DDX41Q9UJV9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DDX41Q9UJV9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
DDX41Q9UJV9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
DDX41Q9UJV9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DDX41Q9UJV9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DDX41Q9UJV9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DDX41Q9UJV9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
DDX41Q9UJV9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DDX41Q9UJV9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DDX41Q9UJV9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
DDX41Q9UJV9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DDX41Q9UJV9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
DDX41Q9UJV9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DDX41Q9UJV9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DDX41Q9UJV9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DDX41Q9UJV9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DDX41Q9UJV9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DDX41Q9UJV9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
DDX41Q9UJV9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
DDX41Q9UJV9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
DDX41Q9UJV9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
DDX41Q9UJV9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
DDX41Q9UJV9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
DDX41Q9UJV9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
DDX41Q9UJV9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDX41Q9UJV9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
DDX41Q9UJV9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDX41Q9UJV9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDX41Q9UJV9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
DDX41Q9UJV9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
DDX41Q9UJV9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
DDX41Q9UJV9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DDX41Q9UJV9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DDX41Q9UJV9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DDX41Q9UJV9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DDX41Q9UJV9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX41Q9UJV9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX41Q9UJV9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX41Q9UJV9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX41Q9UJV9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX41Q9UJV9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX41Q9UJV9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDX41Q9UJV9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDX41Q9UJV9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDX41Q9UJV9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDX41Q9UJV9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDX41Q9UJV9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDX41Q9UJV9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDX41Q9UJV9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDX41Q9UJV9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDX41Q9UJV9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDX41Q9UJV9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDX41Q9UJV9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
DDX41Q9UJV9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DDX41Q9UJV9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DDX41Q9UJV9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DDX41Q9UJV9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DDX41Q9UJV9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DDX41Q9UJV9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DDX41Q9UJV9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DDX41Q9UJV9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDX41Q9UJV9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDX41Q9UJV9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDX41Q9UJV9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
DDX41Q9UJV9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDX41Q9UJV9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDX41Q9UJV9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDX41Q9UJV9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDX41Q9UJV9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDX41Q9UJV9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDX41Q9UJV9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDX41Q9UJV9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDX41Q9UJV9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDX41Q9UJV9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDX41Q9UJV9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDX41Q9UJV9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDX41Q9UJV9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDX41Q9UJV9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms