Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT1

TUBD1, Tubulin delta chain, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBD1Q9UJT1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBD1Q9UJT1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBD1Q9UJT1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBD1Q9UJT1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBD1Q9UJT1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBD1Q9UJT1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBD1Q9UJT1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBD1Q9UJT1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBD1Q9UJT1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBD1Q9UJT1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBD1Q9UJT1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBD1Q9UJT1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBD1Q9UJT1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBD1Q9UJT1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBD1Q9UJT1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBD1Q9UJT1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBD1Q9UJT1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TUBD1Q9UJT1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBD1Q9UJT1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBD1Q9UJT1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBD1Q9UJT1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBD1Q9UJT1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBD1Q9UJT1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBD1Q9UJT1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBD1Q9UJT1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBD1Q9UJT1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBD1Q9UJT1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBD1Q9UJT1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBD1Q9UJT1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBD1Q9UJT1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBD1Q9UJT1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBD1Q9UJT1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBD1Q9UJT1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBD1Q9UJT1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBD1Q9UJT1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBD1Q9UJT1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBD1Q9UJT1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBD1Q9UJT1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBD1Q9UJT1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBD1Q9UJT1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBD1Q9UJT1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBD1Q9UJT1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBD1Q9UJT1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBD1Q9UJT1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBD1Q9UJT1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBD1Q9UJT1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBD1Q9UJT1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBD1Q9UJT1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBD1Q9UJT1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBD1Q9UJT1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBD1Q9UJT1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBD1Q9UJT1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBD1Q9UJT1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBD1Q9UJT1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBD1Q9UJT1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBD1Q9UJT1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBD1Q9UJT1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBD1Q9UJT1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBD1Q9UJT1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBD1Q9UJT1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBD1Q9UJT1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBD1Q9UJT1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBD1Q9UJT1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBD1Q9UJT1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBD1Q9UJT1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBD1Q9UJT1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBD1Q9UJT1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBD1Q9UJT1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBD1Q9UJT1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBD1Q9UJT1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBD1Q9UJT1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBD1Q9UJT1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBD1Q9UJT1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBD1Q9UJT1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBD1Q9UJT1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBD1Q9UJT1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBD1Q9UJT1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBD1Q9UJT1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBD1Q9UJT1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBD1Q9UJT1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBD1Q9UJT1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBD1Q9UJT1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBD1Q9UJT1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBD1Q9UJT1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBD1Q9UJT1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBD1Q9UJT1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBD1Q9UJT1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBD1Q9UJT1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBD1Q9UJT1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBD1Q9UJT1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBD1Q9UJT1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBD1Q9UJT1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TUBD1Q9UJT1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBD1Q9UJT1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBD1Q9UJT1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBD1Q9UJT1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBD1Q9UJT1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBD1Q9UJT1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBD1Q9UJT1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBD1Q9UJT1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms