Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SALL4Q9UJQ4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SALL4Q9UJQ4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SALL4Q9UJQ4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SALL4Q9UJQ4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SALL4Q9UJQ4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SALL4Q9UJQ4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SALL4Q9UJQ4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SALL4Q9UJQ4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SALL4Q9UJQ4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SALL4Q9UJQ4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SALL4Q9UJQ4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SALL4Q9UJQ4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SALL4Q9UJQ4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SALL4Q9UJQ4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SALL4Q9UJQ4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SALL4Q9UJQ4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SALL4Q9UJQ4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SALL4Q9UJQ4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SALL4Q9UJQ4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SALL4Q9UJQ4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SALL4Q9UJQ4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SALL4Q9UJQ4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SALL4Q9UJQ4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SALL4Q9UJQ4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SALL4Q9UJQ4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SALL4Q9UJQ4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SALL4Q9UJQ4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SALL4Q9UJQ4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SALL4Q9UJQ4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SALL4Q9UJQ4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
SALL4Q9UJQ4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SALL4Q9UJQ4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SALL4Q9UJQ4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SALL4Q9UJQ4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SALL4Q9UJQ4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SALL4Q9UJQ4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SALL4Q9UJQ4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SALL4Q9UJQ4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SALL4Q9UJQ4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SALL4Q9UJQ4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SALL4Q9UJQ4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SALL4Q9UJQ4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SALL4Q9UJQ4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SALL4Q9UJQ4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SALL4Q9UJQ4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SALL4Q9UJQ4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SALL4Q9UJQ4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SALL4Q9UJQ4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SALL4Q9UJQ4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SALL4Q9UJQ4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SALL4Q9UJQ4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SALL4Q9UJQ4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SALL4Q9UJQ4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SALL4Q9UJQ4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SALL4Q9UJQ4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SALL4Q9UJQ4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SALL4Q9UJQ4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SALL4Q9UJQ4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SALL4Q9UJQ4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SALL4Q9UJQ4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SALL4Q9UJQ4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SALL4Q9UJQ4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SALL4Q9UJQ4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SALL4Q9UJQ4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SALL4Q9UJQ4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SALL4Q9UJQ4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SALL4Q9UJQ4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SALL4Q9UJQ4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SALL4Q9UJQ4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SALL4Q9UJQ4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SALL4Q9UJQ4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SALL4Q9UJQ4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SALL4Q9UJQ4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SALL4Q9UJQ4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SALL4Q9UJQ4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SALL4Q9UJQ4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SALL4Q9UJQ4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SALL4Q9UJQ4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SALL4Q9UJQ4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SALL4Q9UJQ4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SALL4Q9UJQ4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SALL4Q9UJQ4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SALL4Q9UJQ4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SALL4Q9UJQ4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SALL4Q9UJQ4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SALL4Q9UJQ4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SALL4Q9UJQ4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SALL4Q9UJQ4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SALL4Q9UJQ4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SALL4Q9UJQ4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SALL4Q9UJQ4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SALL4Q9UJQ4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SALL4Q9UJQ4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SALL4Q9UJQ4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SALL4Q9UJQ4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SALL4Q9UJQ4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SALL4Q9UJQ4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SALL4Q9UJQ4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SALL4Q9UJQ4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms