Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIMS3Q9UJD0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIMS3Q9UJD0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIMS3Q9UJD0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIMS3Q9UJD0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIMS3Q9UJD0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIMS3Q9UJD0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIMS3Q9UJD0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
RIMS3Q9UJD0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIMS3Q9UJD0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIMS3Q9UJD0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIMS3Q9UJD0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIMS3Q9UJD0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RIMS3Q9UJD0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RIMS3Q9UJD0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIMS3Q9UJD0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RIMS3Q9UJD0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIMS3Q9UJD0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIMS3Q9UJD0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIMS3Q9UJD0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIMS3Q9UJD0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIMS3Q9UJD0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIMS3Q9UJD0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIMS3Q9UJD0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIMS3Q9UJD0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIMS3Q9UJD0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIMS3Q9UJD0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIMS3Q9UJD0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIMS3Q9UJD0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIMS3Q9UJD0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIMS3Q9UJD0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIMS3Q9UJD0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIMS3Q9UJD0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIMS3Q9UJD0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIMS3Q9UJD0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIMS3Q9UJD0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIMS3Q9UJD0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIMS3Q9UJD0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIMS3Q9UJD0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIMS3Q9UJD0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RIMS3Q9UJD0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIMS3Q9UJD0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIMS3Q9UJD0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIMS3Q9UJD0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIMS3Q9UJD0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIMS3Q9UJD0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIMS3Q9UJD0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RIMS3Q9UJD0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RIMS3Q9UJD0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIMS3Q9UJD0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIMS3Q9UJD0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIMS3Q9UJD0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIMS3Q9UJD0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIMS3Q9UJD0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIMS3Q9UJD0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIMS3Q9UJD0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RIMS3Q9UJD0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RIMS3Q9UJD0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RIMS3Q9UJD0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RIMS3Q9UJD0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RIMS3Q9UJD0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RIMS3Q9UJD0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RIMS3Q9UJD0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIMS3Q9UJD0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIMS3Q9UJD0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIMS3Q9UJD0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RIMS3Q9UJD0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIMS3Q9UJD0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIMS3Q9UJD0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIMS3Q9UJD0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RIMS3Q9UJD0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RIMS3Q9UJD0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RIMS3Q9UJD0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RIMS3Q9UJD0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RIMS3Q9UJD0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RIMS3Q9UJD0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RIMS3Q9UJD0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RIMS3Q9UJD0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RIMS3Q9UJD0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIMS3Q9UJD0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIMS3Q9UJD0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIMS3Q9UJD0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIMS3Q9UJD0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIMS3Q9UJD0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RIMS3Q9UJD0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIMS3Q9UJD0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RIMS3Q9UJD0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIMS3Q9UJD0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIMS3Q9UJD0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIMS3Q9UJD0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIMS3Q9UJD0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIMS3Q9UJD0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIMS3Q9UJD0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIMS3Q9UJD0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIMS3Q9UJD0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIMS3Q9UJD0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIMS3Q9UJD0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIMS3Q9UJD0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIMS3Q9UJD0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIMS3Q9UJD0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms