Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEFF2Q9UIK5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEFF2Q9UIK5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEFF2Q9UIK5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEFF2Q9UIK5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEFF2Q9UIK5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEFF2Q9UIK5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEFF2Q9UIK5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEFF2Q9UIK5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEFF2Q9UIK5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEFF2Q9UIK5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEFF2Q9UIK5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEFF2Q9UIK5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEFF2Q9UIK5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEFF2Q9UIK5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEFF2Q9UIK5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEFF2Q9UIK5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEFF2Q9UIK5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEFF2Q9UIK5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEFF2Q9UIK5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEFF2Q9UIK5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEFF2Q9UIK5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEFF2Q9UIK5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEFF2Q9UIK5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEFF2Q9UIK5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEFF2Q9UIK5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEFF2Q9UIK5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEFF2Q9UIK5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEFF2Q9UIK5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEFF2Q9UIK5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEFF2Q9UIK5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEFF2Q9UIK5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEFF2Q9UIK5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEFF2Q9UIK5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEFF2Q9UIK5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEFF2Q9UIK5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEFF2Q9UIK5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEFF2Q9UIK5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEFF2Q9UIK5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEFF2Q9UIK5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEFF2Q9UIK5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEFF2Q9UIK5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEFF2Q9UIK5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEFF2Q9UIK5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEFF2Q9UIK5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEFF2Q9UIK5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEFF2Q9UIK5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEFF2Q9UIK5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEFF2Q9UIK5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEFF2Q9UIK5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEFF2Q9UIK5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEFF2Q9UIK5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEFF2Q9UIK5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEFF2Q9UIK5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEFF2Q9UIK5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEFF2Q9UIK5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEFF2Q9UIK5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEFF2Q9UIK5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEFF2Q9UIK5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEFF2Q9UIK5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEFF2Q9UIK5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEFF2Q9UIK5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEFF2Q9UIK5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEFF2Q9UIK5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEFF2Q9UIK5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEFF2Q9UIK5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEFF2Q9UIK5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEFF2Q9UIK5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEFF2Q9UIK5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEFF2Q9UIK5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEFF2Q9UIK5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEFF2Q9UIK5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEFF2Q9UIK5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEFF2Q9UIK5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEFF2Q9UIK5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEFF2Q9UIK5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEFF2Q9UIK5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEFF2Q9UIK5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEFF2Q9UIK5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEFF2Q9UIK5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEFF2Q9UIK5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEFF2Q9UIK5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEFF2Q9UIK5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEFF2Q9UIK5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEFF2Q9UIK5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEFF2Q9UIK5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEFF2Q9UIK5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEFF2Q9UIK5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEFF2Q9UIK5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEFF2Q9UIK5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEFF2Q9UIK5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEFF2Q9UIK5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEFF2Q9UIK5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEFF2Q9UIK5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEFF2Q9UIK5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEFF2Q9UIK5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEFF2Q9UIK5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEFF2Q9UIK5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEFF2Q9UIK5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEFF2Q9UIK5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms