Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII4

HERC5, E3 ISG15--protein ligase HERC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC5Q9UII4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
HERC5Q9UII4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
HERC5Q9UII4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
HERC5Q9UII4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
HERC5Q9UII4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
HERC5Q9UII4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
HERC5Q9UII4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
HERC5Q9UII4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
HERC5Q9UII4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
HERC5Q9UII4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
HERC5Q9UII4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
HERC5Q9UII4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
HERC5Q9UII4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
HERC5Q9UII4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
HERC5Q9UII4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
HERC5Q9UII4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
HERC5Q9UII4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
HERC5Q9UII4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
HERC5Q9UII4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
HERC5Q9UII4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
HERC5Q9UII4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
HERC5Q9UII4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
HERC5Q9UII4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
HERC5Q9UII4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
HERC5Q9UII4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
HERC5Q9UII4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
HERC5Q9UII4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
HERC5Q9UII4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
HERC5Q9UII4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
HERC5Q9UII4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HERC5Q9UII4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HERC5Q9UII4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HERC5Q9UII4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HERC5Q9UII4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
HERC5Q9UII4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
HERC5Q9UII4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
HERC5Q9UII4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
HERC5Q9UII4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
HERC5Q9UII4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
HERC5Q9UII4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
HERC5Q9UII4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
HERC5Q9UII4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
HERC5Q9UII4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
HERC5Q9UII4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
HERC5Q9UII4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
HERC5Q9UII4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
HERC5Q9UII4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
HERC5Q9UII4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
HERC5Q9UII4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
HERC5Q9UII4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
HERC5Q9UII4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
HERC5Q9UII4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
HERC5Q9UII4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
HERC5Q9UII4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC30■■■□□ 2.39
HERC5Q9UII4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
HERC5Q9UII4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
HERC5Q9UII4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
HERC5Q9UII4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
HERC5Q9UII4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
HERC5Q9UII4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HERC5Q9UII4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HERC5Q9UII4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HERC5Q9UII4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
HERC5Q9UII4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
HERC5Q9UII4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
HERC5Q9UII4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
HERC5Q9UII4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
HERC5Q9UII4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
HERC5Q9UII4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
HERC5Q9UII4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
HERC5Q9UII4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
HERC5Q9UII4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HERC5Q9UII4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
HERC5Q9UII4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
HERC5Q9UII4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HERC5Q9UII4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HERC5Q9UII4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HERC5Q9UII4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HERC5Q9UII4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
HERC5Q9UII4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
HERC5Q9UII4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
HERC5Q9UII4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
HERC5Q9UII4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HERC5Q9UII4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
HERC5Q9UII4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
HERC5Q9UII4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
HERC5Q9UII4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
HERC5Q9UII4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HERC5Q9UII4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
HERC5Q9UII4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HERC5Q9UII4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HERC5Q9UII4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
HERC5Q9UII4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
HERC5Q9UII4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HERC5Q9UII4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HERC5Q9UII4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HERC5Q9UII4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HERC5Q9UII4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HERC5Q9UII4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HERC5Q9UII4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms