Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP25Q9UHP3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP25Q9UHP3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP25Q9UHP3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP25Q9UHP3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP25Q9UHP3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP25Q9UHP3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP25Q9UHP3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP25Q9UHP3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP25Q9UHP3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP25Q9UHP3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP25Q9UHP3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP25Q9UHP3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP25Q9UHP3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP25Q9UHP3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP25Q9UHP3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP25Q9UHP3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP25Q9UHP3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP25Q9UHP3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
USP25Q9UHP3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
USP25Q9UHP3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP25Q9UHP3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP25Q9UHP3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP25Q9UHP3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP25Q9UHP3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP25Q9UHP3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP25Q9UHP3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP25Q9UHP3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP25Q9UHP3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP25Q9UHP3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP25Q9UHP3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP25Q9UHP3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
USP25Q9UHP3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP25Q9UHP3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP25Q9UHP3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP25Q9UHP3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP25Q9UHP3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP25Q9UHP3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP25Q9UHP3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
USP25Q9UHP3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP25Q9UHP3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP25Q9UHP3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP25Q9UHP3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP25Q9UHP3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP25Q9UHP3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP25Q9UHP3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP25Q9UHP3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP25Q9UHP3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP25Q9UHP3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP25Q9UHP3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
USP25Q9UHP3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP25Q9UHP3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP25Q9UHP3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP25Q9UHP3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP25Q9UHP3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP25Q9UHP3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP25Q9UHP3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP25Q9UHP3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP25Q9UHP3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP25Q9UHP3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP25Q9UHP3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP25Q9UHP3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP25Q9UHP3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP25Q9UHP3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
USP25Q9UHP3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP25Q9UHP3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP25Q9UHP3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP25Q9UHP3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP25Q9UHP3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP25Q9UHP3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
USP25Q9UHP3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP25Q9UHP3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
USP25Q9UHP3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP25Q9UHP3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP25Q9UHP3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
USP25Q9UHP3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP25Q9UHP3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP25Q9UHP3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP25Q9UHP3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP25Q9UHP3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP25Q9UHP3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP25Q9UHP3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP25Q9UHP3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP25Q9UHP3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP25Q9UHP3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP25Q9UHP3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP25Q9UHP3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP25Q9UHP3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP25Q9UHP3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
USP25Q9UHP3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP25Q9UHP3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
USP25Q9UHP3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP25Q9UHP3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP25Q9UHP3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP25Q9UHP3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP25Q9UHP3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP25Q9UHP3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP25Q9UHP3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP25Q9UHP3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP25Q9UHP3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms