Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGGBP1Q9UFW8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGGBP1Q9UFW8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGGBP1Q9UFW8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGGBP1Q9UFW8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGGBP1Q9UFW8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGGBP1Q9UFW8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGGBP1Q9UFW8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGGBP1Q9UFW8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGGBP1Q9UFW8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGGBP1Q9UFW8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGGBP1Q9UFW8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGGBP1Q9UFW8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGGBP1Q9UFW8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGGBP1Q9UFW8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGGBP1Q9UFW8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGGBP1Q9UFW8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGGBP1Q9UFW8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CGGBP1Q9UFW8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CGGBP1Q9UFW8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGGBP1Q9UFW8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CGGBP1Q9UFW8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CGGBP1Q9UFW8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGGBP1Q9UFW8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGGBP1Q9UFW8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGGBP1Q9UFW8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGGBP1Q9UFW8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGGBP1Q9UFW8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGGBP1Q9UFW8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGGBP1Q9UFW8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGGBP1Q9UFW8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGGBP1Q9UFW8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGGBP1Q9UFW8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGGBP1Q9UFW8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGGBP1Q9UFW8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGGBP1Q9UFW8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGGBP1Q9UFW8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CGGBP1Q9UFW8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGGBP1Q9UFW8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGGBP1Q9UFW8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGGBP1Q9UFW8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGGBP1Q9UFW8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGGBP1Q9UFW8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGGBP1Q9UFW8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGGBP1Q9UFW8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CGGBP1Q9UFW8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGGBP1Q9UFW8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGGBP1Q9UFW8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGGBP1Q9UFW8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGGBP1Q9UFW8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGGBP1Q9UFW8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGGBP1Q9UFW8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGGBP1Q9UFW8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGGBP1Q9UFW8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGGBP1Q9UFW8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGGBP1Q9UFW8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGGBP1Q9UFW8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CGGBP1Q9UFW8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CGGBP1Q9UFW8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CGGBP1Q9UFW8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CGGBP1Q9UFW8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CGGBP1Q9UFW8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CGGBP1Q9UFW8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CGGBP1Q9UFW8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CGGBP1Q9UFW8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CGGBP1Q9UFW8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CGGBP1Q9UFW8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CGGBP1Q9UFW8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CGGBP1Q9UFW8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CGGBP1Q9UFW8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CGGBP1Q9UFW8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CGGBP1Q9UFW8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CGGBP1Q9UFW8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CGGBP1Q9UFW8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CGGBP1Q9UFW8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CGGBP1Q9UFW8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CGGBP1Q9UFW8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CGGBP1Q9UFW8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CGGBP1Q9UFW8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CGGBP1Q9UFW8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CGGBP1Q9UFW8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CGGBP1Q9UFW8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CGGBP1Q9UFW8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CGGBP1Q9UFW8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CGGBP1Q9UFW8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CGGBP1Q9UFW8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CGGBP1Q9UFW8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CGGBP1Q9UFW8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CGGBP1Q9UFW8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CGGBP1Q9UFW8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CGGBP1Q9UFW8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CGGBP1Q9UFW8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CGGBP1Q9UFW8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CGGBP1Q9UFW8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CGGBP1Q9UFW8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CGGBP1Q9UFW8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGGBP1Q9UFW8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGGBP1Q9UFW8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGGBP1Q9UFW8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
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