Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ9

REV1, DNA repair protein REV1, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REV1Q9UBZ9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
REV1Q9UBZ9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
REV1Q9UBZ9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
REV1Q9UBZ9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
REV1Q9UBZ9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
REV1Q9UBZ9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
REV1Q9UBZ9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
REV1Q9UBZ9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
REV1Q9UBZ9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
REV1Q9UBZ9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
REV1Q9UBZ9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
REV1Q9UBZ9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
REV1Q9UBZ9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
REV1Q9UBZ9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
REV1Q9UBZ9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
REV1Q9UBZ9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
REV1Q9UBZ9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
REV1Q9UBZ9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
REV1Q9UBZ9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
REV1Q9UBZ9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
REV1Q9UBZ9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
REV1Q9UBZ9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
REV1Q9UBZ9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
REV1Q9UBZ9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
REV1Q9UBZ9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
REV1Q9UBZ9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
REV1Q9UBZ9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
REV1Q9UBZ9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
REV1Q9UBZ9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
REV1Q9UBZ9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
REV1Q9UBZ9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
REV1Q9UBZ9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
REV1Q9UBZ9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
REV1Q9UBZ9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
REV1Q9UBZ9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
REV1Q9UBZ9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
REV1Q9UBZ9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
REV1Q9UBZ9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
REV1Q9UBZ9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
REV1Q9UBZ9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
REV1Q9UBZ9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
REV1Q9UBZ9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
REV1Q9UBZ9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
REV1Q9UBZ9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
REV1Q9UBZ9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
REV1Q9UBZ9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
REV1Q9UBZ9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
REV1Q9UBZ9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
REV1Q9UBZ9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
REV1Q9UBZ9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
REV1Q9UBZ9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
REV1Q9UBZ9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
REV1Q9UBZ9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
REV1Q9UBZ9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
REV1Q9UBZ9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
REV1Q9UBZ9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
REV1Q9UBZ9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
REV1Q9UBZ9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
REV1Q9UBZ9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
REV1Q9UBZ9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
REV1Q9UBZ9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
REV1Q9UBZ9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
REV1Q9UBZ9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
REV1Q9UBZ9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
REV1Q9UBZ9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
REV1Q9UBZ9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
REV1Q9UBZ9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
REV1Q9UBZ9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
REV1Q9UBZ9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
REV1Q9UBZ9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
REV1Q9UBZ9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
REV1Q9UBZ9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
REV1Q9UBZ9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
REV1Q9UBZ9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
REV1Q9UBZ9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
REV1Q9UBZ9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
REV1Q9UBZ9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
REV1Q9UBZ9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
REV1Q9UBZ9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
REV1Q9UBZ9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
REV1Q9UBZ9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
REV1Q9UBZ9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
REV1Q9UBZ9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
REV1Q9UBZ9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
REV1Q9UBZ9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
REV1Q9UBZ9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
REV1Q9UBZ9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
REV1Q9UBZ9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
REV1Q9UBZ9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
REV1Q9UBZ9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
REV1Q9UBZ9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
REV1Q9UBZ9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
REV1Q9UBZ9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
REV1Q9UBZ9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
REV1Q9UBZ9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
REV1Q9UBZ9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
REV1Q9UBZ9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
REV1Q9UBZ9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
REV1Q9UBZ9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
REV1Q9UBZ9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms