Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NXF1Q9UBU9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NXF1Q9UBU9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NXF1Q9UBU9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NXF1Q9UBU9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NXF1Q9UBU9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NXF1Q9UBU9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NXF1Q9UBU9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NXF1Q9UBU9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NXF1Q9UBU9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NXF1Q9UBU9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NXF1Q9UBU9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NXF1Q9UBU9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NXF1Q9UBU9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NXF1Q9UBU9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NXF1Q9UBU9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NXF1Q9UBU9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NXF1Q9UBU9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NXF1Q9UBU9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NXF1Q9UBU9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NXF1Q9UBU9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NXF1Q9UBU9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NXF1Q9UBU9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NXF1Q9UBU9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NXF1Q9UBU9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NXF1Q9UBU9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NXF1Q9UBU9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NXF1Q9UBU9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NXF1Q9UBU9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NXF1Q9UBU9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NXF1Q9UBU9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NXF1Q9UBU9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NXF1Q9UBU9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NXF1Q9UBU9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NXF1Q9UBU9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NXF1Q9UBU9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NXF1Q9UBU9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NXF1Q9UBU9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NXF1Q9UBU9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NXF1Q9UBU9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NXF1Q9UBU9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NXF1Q9UBU9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NXF1Q9UBU9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NXF1Q9UBU9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NXF1Q9UBU9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NXF1Q9UBU9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NXF1Q9UBU9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NXF1Q9UBU9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NXF1Q9UBU9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
NXF1Q9UBU9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NXF1Q9UBU9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NXF1Q9UBU9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NXF1Q9UBU9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NXF1Q9UBU9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NXF1Q9UBU9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NXF1Q9UBU9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NXF1Q9UBU9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NXF1Q9UBU9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NXF1Q9UBU9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NXF1Q9UBU9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NXF1Q9UBU9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NXF1Q9UBU9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NXF1Q9UBU9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NXF1Q9UBU9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NXF1Q9UBU9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NXF1Q9UBU9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NXF1Q9UBU9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NXF1Q9UBU9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NXF1Q9UBU9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NXF1Q9UBU9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
NXF1Q9UBU9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NXF1Q9UBU9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
NXF1Q9UBU9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NXF1Q9UBU9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NXF1Q9UBU9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NXF1Q9UBU9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NXF1Q9UBU9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NXF1Q9UBU9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NXF1Q9UBU9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NXF1Q9UBU9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NXF1Q9UBU9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NXF1Q9UBU9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NXF1Q9UBU9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NXF1Q9UBU9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NXF1Q9UBU9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NXF1Q9UBU9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NXF1Q9UBU9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NXF1Q9UBU9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NXF1Q9UBU9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NXF1Q9UBU9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NXF1Q9UBU9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NXF1Q9UBU9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NXF1Q9UBU9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NXF1Q9UBU9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NXF1Q9UBU9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NXF1Q9UBU9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NXF1Q9UBU9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NXF1Q9UBU9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NXF1Q9UBU9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NXF1Q9UBU9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 589.4 ms