Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBH6

XPR1, Xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPR1Q9UBH6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
XPR1Q9UBH6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
XPR1Q9UBH6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
XPR1Q9UBH6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
XPR1Q9UBH6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
XPR1Q9UBH6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
XPR1Q9UBH6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
XPR1Q9UBH6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
XPR1Q9UBH6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
XPR1Q9UBH6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
XPR1Q9UBH6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
XPR1Q9UBH6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
XPR1Q9UBH6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
XPR1Q9UBH6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
XPR1Q9UBH6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
XPR1Q9UBH6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
XPR1Q9UBH6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
XPR1Q9UBH6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
XPR1Q9UBH6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25■■□□□ 1.59
XPR1Q9UBH6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
XPR1Q9UBH6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
XPR1Q9UBH6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25■■□□□ 1.59
XPR1Q9UBH6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
XPR1Q9UBH6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25■■□□□ 1.59
XPR1Q9UBH6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
XPR1Q9UBH6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
XPR1Q9UBH6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
XPR1Q9UBH6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
XPR1Q9UBH6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
XPR1Q9UBH6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
XPR1Q9UBH6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
XPR1Q9UBH6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
XPR1Q9UBH6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
XPR1Q9UBH6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
XPR1Q9UBH6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
XPR1Q9UBH6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
XPR1Q9UBH6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
XPR1Q9UBH6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
XPR1Q9UBH6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
XPR1Q9UBH6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
XPR1Q9UBH6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
XPR1Q9UBH6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
XPR1Q9UBH6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
XPR1Q9UBH6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
XPR1Q9UBH6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
XPR1Q9UBH6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
XPR1Q9UBH6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
XPR1Q9UBH6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
XPR1Q9UBH6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
XPR1Q9UBH6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
XPR1Q9UBH6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
XPR1Q9UBH6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
XPR1Q9UBH6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
XPR1Q9UBH6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
XPR1Q9UBH6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
XPR1Q9UBH6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
XPR1Q9UBH6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
XPR1Q9UBH6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
XPR1Q9UBH6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
XPR1Q9UBH6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
XPR1Q9UBH6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XPR1Q9UBH6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
XPR1Q9UBH6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
XPR1Q9UBH6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XPR1Q9UBH6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
XPR1Q9UBH6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
XPR1Q9UBH6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
XPR1Q9UBH6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
XPR1Q9UBH6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
XPR1Q9UBH6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
XPR1Q9UBH6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
XPR1Q9UBH6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
XPR1Q9UBH6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XPR1Q9UBH6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XPR1Q9UBH6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XPR1Q9UBH6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XPR1Q9UBH6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XPR1Q9UBH6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XPR1Q9UBH6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
XPR1Q9UBH6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
XPR1Q9UBH6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
XPR1Q9UBH6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
XPR1Q9UBH6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XPR1Q9UBH6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
XPR1Q9UBH6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
XPR1Q9UBH6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
XPR1Q9UBH6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XPR1Q9UBH6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XPR1Q9UBH6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XPR1Q9UBH6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XPR1Q9UBH6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XPR1Q9UBH6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
XPR1Q9UBH6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
XPR1Q9UBH6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
XPR1Q9UBH6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
XPR1Q9UBH6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XPR1Q9UBH6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XPR1Q9UBH6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XPR1Q9UBH6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XPR1Q9UBH6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms