Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE8

NLK, Serine/threonine-protein kinase NLK, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLKQ9UBE8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLKQ9UBE8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLKQ9UBE8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLKQ9UBE8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLKQ9UBE8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLKQ9UBE8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLKQ9UBE8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLKQ9UBE8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLKQ9UBE8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLKQ9UBE8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLKQ9UBE8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLKQ9UBE8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLKQ9UBE8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLKQ9UBE8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLKQ9UBE8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLKQ9UBE8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLKQ9UBE8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLKQ9UBE8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLKQ9UBE8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLKQ9UBE8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLKQ9UBE8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLKQ9UBE8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLKQ9UBE8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLKQ9UBE8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NLKQ9UBE8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLKQ9UBE8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLKQ9UBE8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLKQ9UBE8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLKQ9UBE8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLKQ9UBE8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLKQ9UBE8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLKQ9UBE8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLKQ9UBE8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLKQ9UBE8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLKQ9UBE8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLKQ9UBE8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLKQ9UBE8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLKQ9UBE8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NLKQ9UBE8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLKQ9UBE8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLKQ9UBE8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLKQ9UBE8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLKQ9UBE8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLKQ9UBE8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLKQ9UBE8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLKQ9UBE8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLKQ9UBE8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLKQ9UBE8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NLKQ9UBE8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NLKQ9UBE8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLKQ9UBE8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLKQ9UBE8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLKQ9UBE8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLKQ9UBE8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLKQ9UBE8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLKQ9UBE8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLKQ9UBE8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLKQ9UBE8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NLKQ9UBE8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLKQ9UBE8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLKQ9UBE8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLKQ9UBE8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLKQ9UBE8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NLKQ9UBE8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLKQ9UBE8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLKQ9UBE8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLKQ9UBE8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLKQ9UBE8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLKQ9UBE8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLKQ9UBE8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLKQ9UBE8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLKQ9UBE8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLKQ9UBE8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NLKQ9UBE8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLKQ9UBE8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLKQ9UBE8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLKQ9UBE8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLKQ9UBE8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLKQ9UBE8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLKQ9UBE8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NLKQ9UBE8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NLKQ9UBE8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLKQ9UBE8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLKQ9UBE8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLKQ9UBE8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLKQ9UBE8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLKQ9UBE8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NLKQ9UBE8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLKQ9UBE8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLKQ9UBE8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLKQ9UBE8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLKQ9UBE8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLKQ9UBE8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLKQ9UBE8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLKQ9UBE8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLKQ9UBE8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLKQ9UBE8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLKQ9UBE8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLKQ9UBE8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NLKQ9UBE8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms