Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB4

ATXN10, Ataxin-10, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN10Q9UBB4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATXN10Q9UBB4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ATXN10Q9UBB4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATXN10Q9UBB4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ATXN10Q9UBB4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATXN10Q9UBB4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATXN10Q9UBB4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATXN10Q9UBB4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATXN10Q9UBB4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATXN10Q9UBB4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATXN10Q9UBB4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATXN10Q9UBB4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATXN10Q9UBB4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATXN10Q9UBB4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATXN10Q9UBB4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATXN10Q9UBB4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATXN10Q9UBB4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATXN10Q9UBB4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATXN10Q9UBB4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATXN10Q9UBB4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATXN10Q9UBB4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATXN10Q9UBB4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATXN10Q9UBB4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATXN10Q9UBB4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATXN10Q9UBB4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATXN10Q9UBB4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATXN10Q9UBB4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATXN10Q9UBB4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATXN10Q9UBB4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATXN10Q9UBB4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATXN10Q9UBB4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATXN10Q9UBB4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATXN10Q9UBB4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATXN10Q9UBB4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ATXN10Q9UBB4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATXN10Q9UBB4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ATXN10Q9UBB4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATXN10Q9UBB4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATXN10Q9UBB4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATXN10Q9UBB4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATXN10Q9UBB4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATXN10Q9UBB4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATXN10Q9UBB4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATXN10Q9UBB4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATXN10Q9UBB4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATXN10Q9UBB4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATXN10Q9UBB4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATXN10Q9UBB4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATXN10Q9UBB4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATXN10Q9UBB4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATXN10Q9UBB4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATXN10Q9UBB4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ATXN10Q9UBB4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATXN10Q9UBB4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATXN10Q9UBB4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATXN10Q9UBB4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATXN10Q9UBB4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATXN10Q9UBB4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATXN10Q9UBB4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATXN10Q9UBB4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATXN10Q9UBB4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATXN10Q9UBB4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATXN10Q9UBB4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATXN10Q9UBB4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATXN10Q9UBB4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATXN10Q9UBB4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATXN10Q9UBB4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATXN10Q9UBB4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATXN10Q9UBB4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATXN10Q9UBB4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATXN10Q9UBB4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATXN10Q9UBB4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATXN10Q9UBB4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATXN10Q9UBB4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATXN10Q9UBB4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATXN10Q9UBB4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ATXN10Q9UBB4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATXN10Q9UBB4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATXN10Q9UBB4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATXN10Q9UBB4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATXN10Q9UBB4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATXN10Q9UBB4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATXN10Q9UBB4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATXN10Q9UBB4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATXN10Q9UBB4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATXN10Q9UBB4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATXN10Q9UBB4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATXN10Q9UBB4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATXN10Q9UBB4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATXN10Q9UBB4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATXN10Q9UBB4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATXN10Q9UBB4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATXN10Q9UBB4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATXN10Q9UBB4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATXN10Q9UBB4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATXN10Q9UBB4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATXN10Q9UBB4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATXN10Q9UBB4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATXN10Q9UBB4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATXN10Q9UBB4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms