Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U3

SENP1, Sentrin-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP1Q9P0U3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SENP1Q9P0U3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SENP1Q9P0U3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SENP1Q9P0U3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SENP1Q9P0U3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SENP1Q9P0U3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SENP1Q9P0U3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SENP1Q9P0U3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SENP1Q9P0U3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SENP1Q9P0U3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SENP1Q9P0U3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SENP1Q9P0U3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SENP1Q9P0U3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SENP1Q9P0U3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SENP1Q9P0U3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SENP1Q9P0U3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SENP1Q9P0U3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SENP1Q9P0U3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SENP1Q9P0U3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SENP1Q9P0U3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SENP1Q9P0U3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SENP1Q9P0U3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SENP1Q9P0U3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SENP1Q9P0U3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SENP1Q9P0U3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SENP1Q9P0U3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SENP1Q9P0U3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SENP1Q9P0U3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SENP1Q9P0U3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SENP1Q9P0U3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SENP1Q9P0U3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SENP1Q9P0U3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SENP1Q9P0U3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SENP1Q9P0U3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SENP1Q9P0U3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SENP1Q9P0U3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SENP1Q9P0U3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SENP1Q9P0U3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SENP1Q9P0U3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SENP1Q9P0U3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SENP1Q9P0U3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SENP1Q9P0U3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SENP1Q9P0U3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SENP1Q9P0U3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SENP1Q9P0U3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SENP1Q9P0U3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SENP1Q9P0U3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SENP1Q9P0U3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SENP1Q9P0U3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SENP1Q9P0U3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SENP1Q9P0U3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SENP1Q9P0U3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SENP1Q9P0U3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SENP1Q9P0U3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SENP1Q9P0U3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SENP1Q9P0U3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SENP1Q9P0U3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SENP1Q9P0U3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SENP1Q9P0U3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SENP1Q9P0U3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SENP1Q9P0U3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SENP1Q9P0U3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SENP1Q9P0U3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SENP1Q9P0U3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SENP1Q9P0U3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SENP1Q9P0U3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SENP1Q9P0U3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SENP1Q9P0U3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SENP1Q9P0U3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SENP1Q9P0U3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SENP1Q9P0U3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SENP1Q9P0U3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SENP1Q9P0U3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SENP1Q9P0U3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SENP1Q9P0U3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SENP1Q9P0U3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SENP1Q9P0U3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SENP1Q9P0U3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SENP1Q9P0U3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SENP1Q9P0U3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SENP1Q9P0U3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SENP1Q9P0U3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SENP1Q9P0U3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SENP1Q9P0U3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SENP1Q9P0U3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SENP1Q9P0U3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SENP1Q9P0U3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SENP1Q9P0U3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SENP1Q9P0U3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SENP1Q9P0U3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SENP1Q9P0U3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SENP1Q9P0U3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SENP1Q9P0U3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SENP1Q9P0U3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SENP1Q9P0U3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SENP1Q9P0U3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SENP1Q9P0U3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SENP1Q9P0U3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SENP1Q9P0U3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SENP1Q9P0U3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms