Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU0

FLRT3, Leucine-rich repeat transmembrane protein FLRT3, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLRT3Q9NZU0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FLRT3Q9NZU0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FLRT3Q9NZU0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FLRT3Q9NZU0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FLRT3Q9NZU0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FLRT3Q9NZU0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FLRT3Q9NZU0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FLRT3Q9NZU0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FLRT3Q9NZU0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FLRT3Q9NZU0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FLRT3Q9NZU0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FLRT3Q9NZU0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FLRT3Q9NZU0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FLRT3Q9NZU0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FLRT3Q9NZU0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FLRT3Q9NZU0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FLRT3Q9NZU0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FLRT3Q9NZU0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FLRT3Q9NZU0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FLRT3Q9NZU0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FLRT3Q9NZU0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FLRT3Q9NZU0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FLRT3Q9NZU0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FLRT3Q9NZU0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FLRT3Q9NZU0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FLRT3Q9NZU0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FLRT3Q9NZU0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FLRT3Q9NZU0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FLRT3Q9NZU0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FLRT3Q9NZU0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FLRT3Q9NZU0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FLRT3Q9NZU0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLRT3Q9NZU0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLRT3Q9NZU0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLRT3Q9NZU0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLRT3Q9NZU0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLRT3Q9NZU0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLRT3Q9NZU0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLRT3Q9NZU0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLRT3Q9NZU0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLRT3Q9NZU0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FLRT3Q9NZU0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FLRT3Q9NZU0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FLRT3Q9NZU0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FLRT3Q9NZU0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FLRT3Q9NZU0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FLRT3Q9NZU0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FLRT3Q9NZU0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FLRT3Q9NZU0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FLRT3Q9NZU0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FLRT3Q9NZU0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FLRT3Q9NZU0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FLRT3Q9NZU0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FLRT3Q9NZU0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FLRT3Q9NZU0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FLRT3Q9NZU0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FLRT3Q9NZU0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FLRT3Q9NZU0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FLRT3Q9NZU0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FLRT3Q9NZU0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FLRT3Q9NZU0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FLRT3Q9NZU0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FLRT3Q9NZU0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FLRT3Q9NZU0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FLRT3Q9NZU0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FLRT3Q9NZU0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FLRT3Q9NZU0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FLRT3Q9NZU0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FLRT3Q9NZU0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FLRT3Q9NZU0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FLRT3Q9NZU0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FLRT3Q9NZU0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FLRT3Q9NZU0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FLRT3Q9NZU0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FLRT3Q9NZU0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FLRT3Q9NZU0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FLRT3Q9NZU0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FLRT3Q9NZU0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FLRT3Q9NZU0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FLRT3Q9NZU0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FLRT3Q9NZU0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FLRT3Q9NZU0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FLRT3Q9NZU0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FLRT3Q9NZU0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FLRT3Q9NZU0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FLRT3Q9NZU0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FLRT3Q9NZU0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FLRT3Q9NZU0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FLRT3Q9NZU0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FLRT3Q9NZU0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FLRT3Q9NZU0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FLRT3Q9NZU0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FLRT3Q9NZU0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FLRT3Q9NZU0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FLRT3Q9NZU0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FLRT3Q9NZU0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FLRT3Q9NZU0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FLRT3Q9NZU0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FLRT3Q9NZU0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FLRT3Q9NZU0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms