Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ09

UBAP1, Ubiquitin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP1Q9NZ09 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBAP1Q9NZ09 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBAP1Q9NZ09 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBAP1Q9NZ09 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBAP1Q9NZ09 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBAP1Q9NZ09 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBAP1Q9NZ09 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBAP1Q9NZ09 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBAP1Q9NZ09 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBAP1Q9NZ09 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBAP1Q9NZ09 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBAP1Q9NZ09 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBAP1Q9NZ09 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBAP1Q9NZ09 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBAP1Q9NZ09 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBAP1Q9NZ09 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBAP1Q9NZ09 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBAP1Q9NZ09 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBAP1Q9NZ09 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBAP1Q9NZ09 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBAP1Q9NZ09 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBAP1Q9NZ09 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBAP1Q9NZ09 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBAP1Q9NZ09 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBAP1Q9NZ09 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBAP1Q9NZ09 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBAP1Q9NZ09 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBAP1Q9NZ09 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBAP1Q9NZ09 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBAP1Q9NZ09 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBAP1Q9NZ09 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
UBAP1Q9NZ09 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBAP1Q9NZ09 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBAP1Q9NZ09 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBAP1Q9NZ09 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBAP1Q9NZ09 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBAP1Q9NZ09 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBAP1Q9NZ09 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBAP1Q9NZ09 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBAP1Q9NZ09 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBAP1Q9NZ09 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBAP1Q9NZ09 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBAP1Q9NZ09 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBAP1Q9NZ09 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBAP1Q9NZ09 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBAP1Q9NZ09 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBAP1Q9NZ09 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBAP1Q9NZ09 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBAP1Q9NZ09 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBAP1Q9NZ09 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBAP1Q9NZ09 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBAP1Q9NZ09 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBAP1Q9NZ09 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBAP1Q9NZ09 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBAP1Q9NZ09 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
UBAP1Q9NZ09 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBAP1Q9NZ09 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBAP1Q9NZ09 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBAP1Q9NZ09 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBAP1Q9NZ09 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBAP1Q9NZ09 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBAP1Q9NZ09 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBAP1Q9NZ09 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBAP1Q9NZ09 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBAP1Q9NZ09 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBAP1Q9NZ09 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
UBAP1Q9NZ09 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBAP1Q9NZ09 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBAP1Q9NZ09 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBAP1Q9NZ09 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBAP1Q9NZ09 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBAP1Q9NZ09 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBAP1Q9NZ09 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBAP1Q9NZ09 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBAP1Q9NZ09 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBAP1Q9NZ09 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBAP1Q9NZ09 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBAP1Q9NZ09 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBAP1Q9NZ09 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBAP1Q9NZ09 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBAP1Q9NZ09 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBAP1Q9NZ09 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBAP1Q9NZ09 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
UBAP1Q9NZ09 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBAP1Q9NZ09 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBAP1Q9NZ09 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBAP1Q9NZ09 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBAP1Q9NZ09 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBAP1Q9NZ09 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBAP1Q9NZ09 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBAP1Q9NZ09 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBAP1Q9NZ09 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBAP1Q9NZ09 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBAP1Q9NZ09 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBAP1Q9NZ09 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBAP1Q9NZ09 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBAP1Q9NZ09 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBAP1Q9NZ09 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBAP1Q9NZ09 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBAP1Q9NZ09 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 210.3 ms