Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYY8

FASTKD2, FAST kinase domain-containing protein 2, mitochondrial, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FASTKD2Q9NYY8 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.129e-7■■■■■ 36.3
FASTKD2Q9NYY8 PPP6R2-205ENST00000401672 2199 ntTSL 214.06□□□□□ -0.169e-7■■■■■ 36.3
FASTKD2Q9NYY8 PPP6R2-209ENST00000612753 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.369e-7■■■■■ 36.3
FASTKD2Q9NYY8 PPP6R2-201ENST00000216061 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.459e-7■■■■■ 36.3
FASTKD2Q9NYY8 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.755e-7■■■■■ 36.1
FASTKD2Q9NYY8 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.675e-7■■■■■ 36.1
FASTKD2Q9NYY8 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.625e-7■■■■■ 36.1
FASTKD2Q9NYY8 STXBP2-211ENST00000597068 1785 ntTSL 1 (best)15.74■□□□□ 0.115e-7■■■■■ 36.1
FASTKD2Q9NYY8 STXBP2-217ENST00000599737 1523 ntTSL 515.34■□□□□ 0.055e-7■■■■■ 36.1
FASTKD2Q9NYY8 STXBP2-214ENST00000599400 811 ntTSL 514.79□□□□□ -0.045e-7■■■■■ 36.1
FASTKD2Q9NYY8 STXBP2-219ENST00000600702 770 ntTSL 212.93□□□□□ -0.345e-7■■■■■ 36.1
FASTKD2Q9NYY8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.244e-6■■■■■ 35.9
FASTKD2Q9NYY8 AHDC1-203ENST00000480033 546 ntTSL 518.5■□□□□ 0.551e-6■■■■■ 35.8
FASTKD2Q9NYY8 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.314e-6■■■■■ 35.5
FASTKD2Q9NYY8 GREB1-210ENST00000628795 438 ntTSL 54.82□□□□□ -1.646e-17■■■■■ 35.1
FASTKD2Q9NYY8 CLIC4-204ENST00000497755 672 ntTSL 322.2■■□□□ 1.147e-9■■■■■ 34.7
FASTKD2Q9NYY8 DGKI-206ENST00000470895 922 ntTSL 321.26■□□□□ 0.997e-9■■■■■ 34.7
FASTKD2Q9NYY8 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.737e-9■■■■■ 34.7
FASTKD2Q9NYY8 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.477e-9■■■■■ 34.7
FASTKD2Q9NYY8 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.147e-9■■■■■ 34.7
FASTKD2Q9NYY8 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.157e-9■■■■■ 34.7
FASTKD2Q9NYY8 CLIC4-202ENST00000488683 2723 ntTSL 213.04□□□□□ -0.327e-9■■■■■ 34.7
FASTKD2Q9NYY8 DGKI-209ENST00000483619 551 ntTSL 46.76□□□□□ -1.337e-9■■■■■ 34.7
FASTKD2Q9NYY8 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.457e-9■■■■■ 34.7
FASTKD2Q9NYY8 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.467e-9■■■■■ 34.7
FASTKD2Q9NYY8 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.717e-9■■■■■ 34.7
FASTKD2Q9NYY8 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.342e-6■■■■■ 34.7
FASTKD2Q9NYY8 ZFPM1-202ENST00000562417 497 ntTSL 318.37■□□□□ 0.531e-6■■■■■ 34.6
FASTKD2Q9NYY8 LARP1-211ENST00000521577 817 ntTSL 525.66■■□□□ 1.71e-6■■■■■ 34.5
FASTKD2Q9NYY8 LARP1-208ENST00000518892 399 ntTSL 322.04■■□□□ 1.121e-6■■■■■ 34.5
FASTKD2Q9NYY8 LARP1-204ENST00000518297 2630 ntTSL 521.07■□□□□ 0.961e-6■■■■■ 34.5
FASTKD2Q9NYY8 LARP1-201ENST00000336314 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.411e-6■■■■■ 34.5
FASTKD2Q9NYY8 LARP1-210ENST00000519931 569 ntTSL 47.86□□□□□ -1.151e-6■■■■■ 34.5
FASTKD2Q9NYY8 LARP1-202ENST00000517616 501 ntTSL 53.36□□□□□ -1.871e-6■■■■■ 34.5
FASTKD2Q9NYY8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.522e-6■■■■■ 34.5
FASTKD2Q9NYY8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.196e-8■■■■■ 34.4
FASTKD2Q9NYY8 NIT1-216ENST00000496861 1351 ntTSL 1 (best)26.43■■□□□ 1.826e-8■■■■■ 34.4
FASTKD2Q9NYY8 SH3BP4-204ENST00000416021 593 ntTSL 321.91■■□□□ 1.16e-8■■■■■ 34.4
FASTKD2Q9NYY8 MELTF-205ENST00000473501 2757 ntTSL 221.39■■□□□ 1.016e-8■■■■■ 34.4
FASTKD2Q9NYY8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.886e-8■■■■■ 34.4
FASTKD2Q9NYY8 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.466e-8■■■■■ 34.4
FASTKD2Q9NYY8 NIT1-213ENST00000491497 1078 ntTSL 515.26■□□□□ 0.036e-8■■■■■ 34.4
FASTKD2Q9NYY8 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.016e-8■■■■■ 34.4
FASTKD2Q9NYY8 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.076e-8■■■■■ 34.4
FASTKD2Q9NYY8 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.116e-8■■■■■ 34.4
FASTKD2Q9NYY8 NIT1-209ENST00000479266 567 ntTSL 314.27□□□□□ -0.136e-8■■■■■ 34.4
FASTKD2Q9NYY8 NIT1-212ENST00000486962 550 ntTSL 313.67□□□□□ -0.226e-8■■■■■ 34.4
FASTKD2Q9NYY8 NIT1-208ENST00000478277 370 ntTSL 313.12□□□□□ -0.316e-8■■■■■ 34.4
FASTKD2Q9NYY8 NIT1-215ENST00000496768 790 ntTSL 312□□□□□ -0.496e-8■■■■■ 34.4
FASTKD2Q9NYY8 NIT1-214ENST00000492411 823 ntTSL 511.56□□□□□ -0.566e-8■■■■■ 34.4
FASTKD2Q9NYY8 NIT1-207ENST00000477684 499 ntTSL 39.84□□□□□ -0.836e-8■■■■■ 34.4
FASTKD2Q9NYY8 LINC00894-205ENST00000449111 3414 ntTSL 59.75□□□□□ -0.856e-8■■■■■ 34.4
FASTKD2Q9NYY8 NIT1-206ENST00000473918 223 ntTSL 37.6□□□□□ -1.196e-8■■■■■ 34.4
FASTKD2Q9NYY8 FOXN3-210ENST00000555658 648 ntTSL 34.24□□□□□ -1.736e-8■■■■■ 34.4
FASTKD2Q9NYY8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.862e-7■■■■■ 34.4
FASTKD2Q9NYY8 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.182e-7■■■■■ 34.4
FASTKD2Q9NYY8 AGAP1-212ENST00000614409 9932 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.622e-7■■■■■ 34.4
FASTKD2Q9NYY8 AGAP1-207ENST00000428334 10090 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.752e-7■■■■■ 34.4
FASTKD2Q9NYY8 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.387e-8■■■■■ 34.3
FASTKD2Q9NYY8 GMDS-AS1-209ENST00000532124 629 ntTSL 420.82■□□□□ 0.921e-6■■■■■ 34.3
FASTKD2Q9NYY8 GMDS-AS1-203ENST00000524770 565 ntTSL 320.82■□□□□ 0.921e-6■■■■■ 34.3
FASTKD2Q9NYY8 GMDS-AS1-206ENST00000530346 594 ntTSL 418.77■□□□□ 0.61e-6■■■■■ 34.3
FASTKD2Q9NYY8 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.341e-6■■■■■ 34.3
FASTKD2Q9NYY8 GMDS-AS1-208ENST00000531092 744 ntTSL 313.07□□□□□ -0.321e-6■■■■■ 34.3
FASTKD2Q9NYY8 GMDS-AS1-214ENST00000534468 724 ntTSL 311.94□□□□□ -0.51e-6■■■■■ 34.3
FASTKD2Q9NYY8 GMDS-AS1-213ENST00000534441 738 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.811e-6■■■■■ 34.3
FASTKD2Q9NYY8 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.565e-9■■■■■ 34.3
FASTKD2Q9NYY8 CSNK1D-221ENST00000582844 957 ntTSL 521.95■■□□□ 1.12e-12■■■■■ 34.1
FASTKD2Q9NYY8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.862e-12■■■■■ 34.1
FASTKD2Q9NYY8 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.492e-12■■■■■ 34.1
FASTKD2Q9NYY8 CSNK1D-205ENST00000403276 1040 ntTSL 217.37■□□□□ 0.372e-12■■■■■ 34.1
FASTKD2Q9NYY8 CSNK1D-223ENST00000584472 586 ntTSL 416.63■□□□□ 0.252e-12■■■■■ 34.1
FASTKD2Q9NYY8 CSNK1D-217ENST00000581241 6094 ntTSL 215.05■□□□□ -02e-12■■■■■ 34.1
FASTKD2Q9NYY8 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.062e-12■■■■■ 34.1
FASTKD2Q9NYY8 CSNK1D-213ENST00000580446 612 ntTSL 313.88□□□□□ -0.192e-12■■■■■ 34.1
FASTKD2Q9NYY8 CSNK1D-219ENST00000581660 611 ntTSL 513.87□□□□□ -0.192e-12■■■■■ 34.1
FASTKD2Q9NYY8 CSNK1D-211ENST00000579316 692 ntTSL 213.87□□□□□ -0.192e-12■■■■■ 34.1
FASTKD2Q9NYY8 CSNK1D-207ENST00000578194 567 ntTSL 413.21□□□□□ -0.292e-12■■■■■ 34.1
FASTKD2Q9NYY8 CSNK1D-218ENST00000581655 549 ntTSL 412.63□□□□□ -0.392e-12■■■■■ 34.1
FASTKD2Q9NYY8 CSNK1D-226ENST00000585026 563 ntTSL 510.93□□□□□ -0.662e-12■■■■■ 34.1
FASTKD2Q9NYY8 CSNK1D-210ENST00000579308 598 ntTSL 210.9□□□□□ -0.662e-12■■■■■ 34.1
FASTKD2Q9NYY8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.843e-6■■■■■ 34
FASTKD2Q9NYY8 SBNO2-207ENST00000590176 561 ntTSL 419.66■□□□□ 0.743e-6■■■■■ 34
FASTKD2Q9NYY8 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.473e-6■■■■■ 34
FASTKD2Q9NYY8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.92■□□□□ 0.945e-7■■■■■ 33.9
FASTKD2Q9NYY8 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.765e-7■■■■■ 33.9
FASTKD2Q9NYY8 AL390719.1-203ENST00000456409 750 ntTSL 211.74□□□□□ -0.535e-7■■■■■ 33.9
FASTKD2Q9NYY8 AL390719.1-202ENST00000394517 397 ntTSL 59.81□□□□□ -0.845e-7■■■■■ 33.9
FASTKD2Q9NYY8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.928e-9■■■■■ 33.9
FASTKD2Q9NYY8 ARHGAP5-208ENST00000555814 583 ntTSL 49.44□□□□□ -0.98e-9■■■■■ 33.9
FASTKD2Q9NYY8 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.538e-9■■■■■ 33.9
FASTKD2Q9NYY8 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.578e-9■■■■■ 33.9
FASTKD2Q9NYY8 SMARCC2-204ENST00000547356 741 ntTSL 224.21■■□□□ 1.474e-9■■■■■ 33.7
FASTKD2Q9NYY8 SMARCC2-210ENST00000550519 789 ntTSL 322.23■■□□□ 1.154e-9■■■■■ 33.7
FASTKD2Q9NYY8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.724e-9■■■■■ 33.7
FASTKD2Q9NYY8 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.724e-9■■■■■ 33.7
FASTKD2Q9NYY8 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.664e-12■■■■■ 33.7
FASTKD2Q9NYY8 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.464e-9■■■■■ 33.7
FASTKD2Q9NYY8 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.454e-12■■■■■ 33.7
FASTKD2Q9NYY8 SLC39A7-204ENST00000463972 1410 ntTSL 214.05□□□□□ -0.164e-12■■■■■ 33.7
Retrieved 100 of 9,514 protein–RNA pairs in 168.6 ms