Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYY8

FASTKD2, FAST kinase domain-containing protein 2, mitochondrial, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FASTKD2Q9NYY8 HOXC10-205ENST00000515593 526 ntTSL 48.32□□□□□ -1.083e-94■■■■■ 1571.8
FASTKD2Q9NYY8 MT-ND6-201ENST00000361681 525 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.351e-323■■■■■ 820.5
FASTKD2Q9NYY8 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC5.14□□□□□ -1.591e-323■■■■■ 556.7
FASTKD2Q9NYY8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.146e-8■■■■■ 441
FASTKD2Q9NYY8 PCBD2-202ENST00000504352 961 ntTSL 58.82□□□□□ -16e-8■■■■■ 441
FASTKD2Q9NYY8 PCBD2-204ENST00000512783 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.046e-8■■■■■ 441
FASTKD2Q9NYY8 PCBD2-203ENST00000510013 361 ntTSL 53.17□□□□□ -1.96e-8■■■■■ 441
FASTKD2Q9NYY8 PTAR1-201ENST00000340434 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.664e-17■■■■■ 314.7
FASTKD2Q9NYY8 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.754e-17■■■■■ 314.7
FASTKD2Q9NYY8 PTAR1-206ENST00000474925 616 ntTSL 23.93□□□□□ -1.784e-17■■■■■ 314.7
FASTKD2Q9NYY8 PARG-204ENST00000610922 1487 ntTSL 217.37■□□□□ 0.377e-38■■■■■ 289
FASTKD2Q9NYY8 PARG-207ENST00000616448 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.427e-38■■■■■ 289
FASTKD2Q9NYY8 PARG-201ENST00000402038 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.517e-38■■■■■ 289
FASTKD2Q9NYY8 PARG-206ENST00000614063 3473 ntTSL 210.44□□□□□ -0.747e-38■■■■■ 289
FASTKD2Q9NYY8 PARG-202ENST00000492350 556 ntTSL 39.36□□□□□ -0.917e-38■■■■■ 289
FASTKD2Q9NYY8 SGPL1-204ENST00000486993 537 ntTSL 1 (best)21.38■■□□□ 1.011e-68■■■■■ 287.9
FASTKD2Q9NYY8 SGPL1-202ENST00000373202 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.571e-68■■■■■ 287.9
FASTKD2Q9NYY8 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.573e-30■■■■■ 247.4
FASTKD2Q9NYY8 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.613e-30■■■■■ 247.4
FASTKD2Q9NYY8 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.623e-30■■■■■ 247.4
FASTKD2Q9NYY8 CSMD3-202ENST00000339701 10773 ntTSL 1 (best)3.25□□□□□ -1.893e-30■■■■■ 247.4
FASTKD2Q9NYY8 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.292e-71■■■■■ 214.3
FASTKD2Q9NYY8 FBXO16-210ENST00000521548 2983 ntTSL 213.44□□□□□ -0.262e-27■■■■■ 196.9
FASTKD2Q9NYY8 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.422e-27■■■■■ 196.9
FASTKD2Q9NYY8 FBXO16-201ENST00000346498 1205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.472e-27■■■■■ 196.9
FASTKD2Q9NYY8 FBXO16-203ENST00000517436 554 ntTSL 49.92□□□□□ -0.822e-27■■■■■ 196.9
FASTKD2Q9NYY8 FBXO16-205ENST00000518016 495 ntTSL 57.86□□□□□ -1.152e-27■■■■■ 196.9
FASTKD2Q9NYY8 FBXO16-204ENST00000517673 607 ntTSL 57.86□□□□□ -1.152e-27■■■■■ 196.9
FASTKD2Q9NYY8 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.32e-27■■■■■ 196.9
FASTKD2Q9NYY8 FBXO16-209ENST00000520481 598 ntTSL 33.79□□□□□ -1.82e-27■■■■■ 196.9
FASTKD2Q9NYY8 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.611e-323■■■■■ 189.9
FASTKD2Q9NYY8 C1orf186-201ENST00000331555 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.492e-15■■■■■ 186.9
FASTKD2Q9NYY8 C1orf186-203ENST00000582070 1145 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.672e-15■■■■■ 186.9
FASTKD2Q9NYY8 C1orf186-209ENST00000603488 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.92e-15■■■■■ 186.9
FASTKD2Q9NYY8 C1orf186-208ENST00000603378 614 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.962e-15■■■■■ 186.9
FASTKD2Q9NYY8 ULK1-204ENST00000540647 1211 ntTSL 220.31■□□□□ 0.842e-19■■■■■ 172.6
FASTKD2Q9NYY8 FOXRED1-203ENST00000525083 1228 ntTSL 218.17■□□□□ 0.54e-49■■■■■ 168.5
FASTKD2Q9NYY8 FOXRED1-207ENST00000527004 1760 ntTSL 516.56■□□□□ 0.244e-49■■■■■ 168.5
FASTKD2Q9NYY8 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.224e-49■■■■■ 168.5
FASTKD2Q9NYY8 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.164e-49■■■■■ 168.5
FASTKD2Q9NYY8 FOXRED1-204ENST00000525770 1427 ntTSL 215.07■□□□□ 04e-49■■■■■ 168.5
FASTKD2Q9NYY8 FOXRED1-218ENST00000534315 2210 ntTSL 1 (best)14.19□□□□□ -0.144e-49■■■■■ 168.5
FASTKD2Q9NYY8 FOXRED1-217ENST00000534011 1955 ntTSL 214.18□□□□□ -0.144e-49■■■■■ 168.5
FASTKD2Q9NYY8 FOXRED1-216ENST00000533839 559 ntTSL 49.97□□□□□ -0.814e-49■■■■■ 168.5
FASTKD2Q9NYY8 FOXRED1-210ENST00000530642 3045 ntTSL 28.6□□□□□ -1.034e-49■■■■■ 168.5
FASTKD2Q9NYY8 MTND6P22-201ENST00000604233 521 ntBASIC9.89□□□□□ -0.833e-17■■■■■ 167.3
FASTKD2Q9NYY8 ULK1-205ENST00000541761 1262 ntTSL 216.25■□□□□ 0.194e-10■■■■■ 132.9
FASTKD2Q9NYY8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.834e-7■■■■■ 126.9
FASTKD2Q9NYY8 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.021e-16■■■■■ 120.7
FASTKD2Q9NYY8 FAM98B-204ENST00000559431 305 ntTSL 511.22□□□□□ -0.611e-16■■■■■ 120.7
FASTKD2Q9NYY8 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.541e-9■■■■■ 119.5
FASTKD2Q9NYY8 BAGE2-201ENST00000470054 1891 ntTSL 1 (best)15.5■□□□□ 0.071e-9■■■■■ 119.5
FASTKD2Q9NYY8 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.253e-9■■■■■ 111
FASTKD2Q9NYY8 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.125e-26■■■■■ 110.9
FASTKD2Q9NYY8 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.115e-26■■■■■ 110.9
FASTKD2Q9NYY8 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.065e-26■■■■■ 110.9
FASTKD2Q9NYY8 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.045e-26■■■■■ 110.9
FASTKD2Q9NYY8 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.15e-26■■■■■ 110.9
FASTKD2Q9NYY8 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.15e-26■■■■■ 110.9
FASTKD2Q9NYY8 OPA1-214ENST00000482865 567 ntTSL 43.16□□□□□ -1.95e-26■■■■■ 110.9
FASTKD2Q9NYY8 ATP2B2-204ENST00000397077 8964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.561e-14■■■■■ 107.7
FASTKD2Q9NYY8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.82e-11■■■■■ 104.2
FASTKD2Q9NYY8 SETBP1-201ENST00000282030 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.882e-11■■■■■ 104.2
FASTKD2Q9NYY8 WNT5B-205ENST00000539198 530 ntTSL 422.62■■□□□ 1.211e-12■■■■■ 99.2
FASTKD2Q9NYY8 WNT5B-210ENST00000545811 661 ntTSL 220.58■□□□□ 0.891e-12■■■■■ 99.2
FASTKD2Q9NYY8 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.371e-13■■■■■ 98.4
FASTKD2Q9NYY8 SULF1-223ENST00000616868 3381 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.581e-13■■■■■ 98.4
FASTKD2Q9NYY8 SULF1-203ENST00000419716 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.781e-13■■■■■ 98.4
FASTKD2Q9NYY8 SULF1-205ENST00000521946 3004 ntTSL 1 (best)8.62□□□□□ -1.031e-13■■■■■ 98.4
FASTKD2Q9NYY8 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.291e-13■■■■■ 98.4
FASTKD2Q9NYY8 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.551e-13■■■■■ 98.4
FASTKD2Q9NYY8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 13e-16■■■■■ 93.5
FASTKD2Q9NYY8 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.18□□□□□ -2.381e-323■■■■■ 93.3
FASTKD2Q9NYY8 ARMC3-201ENST00000298032 2811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.944e-30■■■■■ 89.4
FASTKD2Q9NYY8 ARMC3-202ENST00000376528 3258 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.014e-30■■■■■ 89.4
FASTKD2Q9NYY8 ARMC3-204ENST00000409983 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.084e-30■■■■■ 89.4
FASTKD2Q9NYY8 ARMC3-203ENST00000409049 2479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.134e-30■■■■■ 89.4
FASTKD2Q9NYY8 ARMC3-211ENST00000484642 974 ntTSL 53.7□□□□□ -1.824e-30■■■■■ 89.4
FASTKD2Q9NYY8 ARMC3-213ENST00000496741 572 ntTSL 42.39□□□□□ -2.034e-30■■■■■ 89.4
FASTKD2Q9NYY8 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC14.48□□□□□ -0.092e-8■■■■■ 85.7
FASTKD2Q9NYY8 SNORD3B-1-203ENST00000631292 217 nt11.66□□□□□ -0.542e-8■■■■■ 85.7
FASTKD2Q9NYY8 SNORD3B-1-202ENST00000617128 218 nt11.57□□□□□ -0.562e-8■■■■■ 85.7
FASTKD2Q9NYY8 FAM178B-205ENST00000494172 592 ntTSL 318.69■□□□□ 0.588e-39■■■■■ 82.2
FASTKD2Q9NYY8 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.468e-39■■■■■ 82.2
FASTKD2Q9NYY8 FAM178B-201ENST00000393526 1004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.268e-39■■■■■ 82.2
FASTKD2Q9NYY8 FAM178B-202ENST00000470789 722 ntTSL 1 (best)11.76□□□□□ -0.538e-39■■■■■ 82.2
FASTKD2Q9NYY8 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.67□□□□□ -2.148e-18■■■■■ 82
FASTKD2Q9NYY8 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.383e-11■■■■■ 81.1
FASTKD2Q9NYY8 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.173e-11■■■■■ 81.1
FASTKD2Q9NYY8 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.123e-11■■■■■ 81.1
FASTKD2Q9NYY8 PRKN-207ENST00000479615 904 ntTSL 515.55■□□□□ 0.083e-11■■■■■ 81.1
FASTKD2Q9NYY8 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.013e-11■■■■■ 81.1
FASTKD2Q9NYY8 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.23e-11■■■■■ 81.1
FASTKD2Q9NYY8 RNF213-201ENST00000319921 5316 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.373e-11■■■■■ 81.1
FASTKD2Q9NYY8 PRKN-206ENST00000366898 4180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.523e-11■■■■■ 81.1
FASTKD2Q9NYY8 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.233e-11■■■■■ 81.1
FASTKD2Q9NYY8 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.53e-11■■■■■ 81.1
FASTKD2Q9NYY8 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.433e-10■■■■■ 80.5
FASTKD2Q9NYY8 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.033e-10■■■■■ 80.5
FASTKD2Q9NYY8 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-202ENST00000584900 1636 ntTSL 218.41■□□□□ 0.545e-7■■■■■ 80.1
Retrieved 100 of 9,514 protein–RNA pairs in 33.6 ms