Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY65

TUBA8, Tubulin alpha-8 chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA8Q9NY65 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBA8Q9NY65 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBA8Q9NY65 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBA8Q9NY65 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBA8Q9NY65 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBA8Q9NY65 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBA8Q9NY65 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBA8Q9NY65 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBA8Q9NY65 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBA8Q9NY65 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBA8Q9NY65 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBA8Q9NY65 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBA8Q9NY65 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBA8Q9NY65 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBA8Q9NY65 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBA8Q9NY65 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBA8Q9NY65 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBA8Q9NY65 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBA8Q9NY65 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBA8Q9NY65 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBA8Q9NY65 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBA8Q9NY65 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBA8Q9NY65 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBA8Q9NY65 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBA8Q9NY65 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBA8Q9NY65 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBA8Q9NY65 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBA8Q9NY65 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBA8Q9NY65 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBA8Q9NY65 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBA8Q9NY65 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBA8Q9NY65 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TUBA8Q9NY65 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TUBA8Q9NY65 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBA8Q9NY65 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBA8Q9NY65 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
TUBA8Q9NY65 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TUBA8Q9NY65 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBA8Q9NY65 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBA8Q9NY65 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBA8Q9NY65 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBA8Q9NY65 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBA8Q9NY65 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBA8Q9NY65 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBA8Q9NY65 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBA8Q9NY65 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBA8Q9NY65 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBA8Q9NY65 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBA8Q9NY65 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBA8Q9NY65 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBA8Q9NY65 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBA8Q9NY65 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBA8Q9NY65 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBA8Q9NY65 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBA8Q9NY65 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBA8Q9NY65 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBA8Q9NY65 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBA8Q9NY65 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBA8Q9NY65 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBA8Q9NY65 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBA8Q9NY65 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBA8Q9NY65 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBA8Q9NY65 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBA8Q9NY65 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBA8Q9NY65 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBA8Q9NY65 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBA8Q9NY65 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBA8Q9NY65 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBA8Q9NY65 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBA8Q9NY65 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBA8Q9NY65 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBA8Q9NY65 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBA8Q9NY65 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBA8Q9NY65 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBA8Q9NY65 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBA8Q9NY65 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBA8Q9NY65 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBA8Q9NY65 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBA8Q9NY65 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBA8Q9NY65 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBA8Q9NY65 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBA8Q9NY65 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBA8Q9NY65 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBA8Q9NY65 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBA8Q9NY65 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBA8Q9NY65 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBA8Q9NY65 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBA8Q9NY65 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBA8Q9NY65 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBA8Q9NY65 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBA8Q9NY65 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TUBA8Q9NY65 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TUBA8Q9NY65 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TUBA8Q9NY65 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBA8Q9NY65 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBA8Q9NY65 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBA8Q9NY65 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBA8Q9NY65 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBA8Q9NY65 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBA8Q9NY65 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140 ms