Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXB0

MKS1, Meckel syndrome type 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1Q9NXB0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MKS1Q9NXB0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MKS1Q9NXB0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MKS1Q9NXB0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MKS1Q9NXB0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MKS1Q9NXB0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MKS1Q9NXB0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MKS1Q9NXB0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MKS1Q9NXB0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MKS1Q9NXB0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MKS1Q9NXB0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MKS1Q9NXB0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MKS1Q9NXB0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MKS1Q9NXB0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MKS1Q9NXB0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MKS1Q9NXB0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MKS1Q9NXB0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MKS1Q9NXB0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MKS1Q9NXB0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MKS1Q9NXB0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MKS1Q9NXB0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MKS1Q9NXB0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MKS1Q9NXB0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MKS1Q9NXB0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MKS1Q9NXB0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MKS1Q9NXB0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MKS1Q9NXB0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MKS1Q9NXB0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MKS1Q9NXB0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MKS1Q9NXB0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MKS1Q9NXB0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MKS1Q9NXB0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MKS1Q9NXB0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MKS1Q9NXB0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MKS1Q9NXB0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MKS1Q9NXB0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MKS1Q9NXB0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MKS1Q9NXB0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MKS1Q9NXB0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MKS1Q9NXB0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MKS1Q9NXB0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MKS1Q9NXB0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MKS1Q9NXB0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MKS1Q9NXB0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MKS1Q9NXB0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MKS1Q9NXB0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MKS1Q9NXB0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MKS1Q9NXB0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MKS1Q9NXB0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
MKS1Q9NXB0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MKS1Q9NXB0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MKS1Q9NXB0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MKS1Q9NXB0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MKS1Q9NXB0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MKS1Q9NXB0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MKS1Q9NXB0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MKS1Q9NXB0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MKS1Q9NXB0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MKS1Q9NXB0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MKS1Q9NXB0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MKS1Q9NXB0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MKS1Q9NXB0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MKS1Q9NXB0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MKS1Q9NXB0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MKS1Q9NXB0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MKS1Q9NXB0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MKS1Q9NXB0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MKS1Q9NXB0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MKS1Q9NXB0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MKS1Q9NXB0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MKS1Q9NXB0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MKS1Q9NXB0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MKS1Q9NXB0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MKS1Q9NXB0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MKS1Q9NXB0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MKS1Q9NXB0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MKS1Q9NXB0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MKS1Q9NXB0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MKS1Q9NXB0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MKS1Q9NXB0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MKS1Q9NXB0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MKS1Q9NXB0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MKS1Q9NXB0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MKS1Q9NXB0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MKS1Q9NXB0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MKS1Q9NXB0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MKS1Q9NXB0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MKS1Q9NXB0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MKS1Q9NXB0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MKS1Q9NXB0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MKS1Q9NXB0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MKS1Q9NXB0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MKS1Q9NXB0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MKS1Q9NXB0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MKS1Q9NXB0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MKS1Q9NXB0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MKS1Q9NXB0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MKS1Q9NXB0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MKS1Q9NXB0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MKS1Q9NXB0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.1 ms