Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX47

MARCH5, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH5, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH5Q9NX47 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MARCH5Q9NX47 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MARCH5Q9NX47 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MARCH5Q9NX47 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MARCH5Q9NX47 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MARCH5Q9NX47 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MARCH5Q9NX47 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MARCH5Q9NX47 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MARCH5Q9NX47 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MARCH5Q9NX47 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MARCH5Q9NX47 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MARCH5Q9NX47 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MARCH5Q9NX47 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MARCH5Q9NX47 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MARCH5Q9NX47 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MARCH5Q9NX47 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
MARCH5Q9NX47 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MARCH5Q9NX47 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MARCH5Q9NX47 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MARCH5Q9NX47 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MARCH5Q9NX47 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
MARCH5Q9NX47 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MARCH5Q9NX47 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
MARCH5Q9NX47 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MARCH5Q9NX47 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MARCH5Q9NX47 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MARCH5Q9NX47 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MARCH5Q9NX47 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MARCH5Q9NX47 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MARCH5Q9NX47 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MARCH5Q9NX47 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MARCH5Q9NX47 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MARCH5Q9NX47 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MARCH5Q9NX47 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MARCH5Q9NX47 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MARCH5Q9NX47 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MARCH5Q9NX47 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MARCH5Q9NX47 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MARCH5Q9NX47 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MARCH5Q9NX47 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MARCH5Q9NX47 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MARCH5Q9NX47 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MARCH5Q9NX47 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MARCH5Q9NX47 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MARCH5Q9NX47 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MARCH5Q9NX47 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
MARCH5Q9NX47 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MARCH5Q9NX47 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MARCH5Q9NX47 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MARCH5Q9NX47 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MARCH5Q9NX47 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MARCH5Q9NX47 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MARCH5Q9NX47 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MARCH5Q9NX47 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MARCH5Q9NX47 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MARCH5Q9NX47 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MARCH5Q9NX47 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
MARCH5Q9NX47 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MARCH5Q9NX47 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MARCH5Q9NX47 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MARCH5Q9NX47 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MARCH5Q9NX47 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MARCH5Q9NX47 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MARCH5Q9NX47 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MARCH5Q9NX47 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
MARCH5Q9NX47 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MARCH5Q9NX47 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MARCH5Q9NX47 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MARCH5Q9NX47 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MARCH5Q9NX47 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MARCH5Q9NX47 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
MARCH5Q9NX47 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MARCH5Q9NX47 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MARCH5Q9NX47 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MARCH5Q9NX47 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MARCH5Q9NX47 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MARCH5Q9NX47 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MARCH5Q9NX47 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MARCH5Q9NX47 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MARCH5Q9NX47 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MARCH5Q9NX47 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
MARCH5Q9NX47 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MARCH5Q9NX47 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MARCH5Q9NX47 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MARCH5Q9NX47 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MARCH5Q9NX47 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MARCH5Q9NX47 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MARCH5Q9NX47 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MARCH5Q9NX47 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MARCH5Q9NX47 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MARCH5Q9NX47 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MARCH5Q9NX47 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
MARCH5Q9NX47 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MARCH5Q9NX47 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MARCH5Q9NX47 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MARCH5Q9NX47 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MARCH5Q9NX47 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MARCH5Q9NX47 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MARCH5Q9NX47 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
MARCH5Q9NX47 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms