Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUS5

AP5S1, AP-5 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5S1Q9NUS5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP5S1Q9NUS5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP5S1Q9NUS5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP5S1Q9NUS5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP5S1Q9NUS5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP5S1Q9NUS5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP5S1Q9NUS5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP5S1Q9NUS5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP5S1Q9NUS5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP5S1Q9NUS5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP5S1Q9NUS5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP5S1Q9NUS5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
AP5S1Q9NUS5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
AP5S1Q9NUS5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
AP5S1Q9NUS5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AP5S1Q9NUS5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AP5S1Q9NUS5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
AP5S1Q9NUS5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
AP5S1Q9NUS5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AP5S1Q9NUS5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP5S1Q9NUS5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP5S1Q9NUS5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP5S1Q9NUS5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP5S1Q9NUS5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP5S1Q9NUS5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP5S1Q9NUS5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP5S1Q9NUS5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP5S1Q9NUS5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP5S1Q9NUS5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP5S1Q9NUS5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP5S1Q9NUS5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP5S1Q9NUS5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP5S1Q9NUS5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP5S1Q9NUS5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP5S1Q9NUS5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP5S1Q9NUS5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP5S1Q9NUS5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
AP5S1Q9NUS5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP5S1Q9NUS5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP5S1Q9NUS5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP5S1Q9NUS5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP5S1Q9NUS5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP5S1Q9NUS5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP5S1Q9NUS5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP5S1Q9NUS5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP5S1Q9NUS5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP5S1Q9NUS5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP5S1Q9NUS5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP5S1Q9NUS5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP5S1Q9NUS5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP5S1Q9NUS5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP5S1Q9NUS5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AP5S1Q9NUS5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
AP5S1Q9NUS5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AP5S1Q9NUS5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AP5S1Q9NUS5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP5S1Q9NUS5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP5S1Q9NUS5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP5S1Q9NUS5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP5S1Q9NUS5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP5S1Q9NUS5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP5S1Q9NUS5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP5S1Q9NUS5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP5S1Q9NUS5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP5S1Q9NUS5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP5S1Q9NUS5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
AP5S1Q9NUS5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP5S1Q9NUS5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP5S1Q9NUS5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP5S1Q9NUS5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP5S1Q9NUS5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP5S1Q9NUS5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP5S1Q9NUS5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP5S1Q9NUS5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP5S1Q9NUS5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP5S1Q9NUS5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP5S1Q9NUS5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP5S1Q9NUS5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP5S1Q9NUS5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP5S1Q9NUS5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP5S1Q9NUS5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP5S1Q9NUS5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP5S1Q9NUS5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
AP5S1Q9NUS5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP5S1Q9NUS5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP5S1Q9NUS5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP5S1Q9NUS5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP5S1Q9NUS5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP5S1Q9NUS5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP5S1Q9NUS5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP5S1Q9NUS5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP5S1Q9NUS5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP5S1Q9NUS5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP5S1Q9NUS5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP5S1Q9NUS5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP5S1Q9NUS5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP5S1Q9NUS5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP5S1Q9NUS5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP5S1Q9NUS5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP5S1Q9NUS5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms