Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GJB4Q9NTQ9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GJB4Q9NTQ9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GJB4Q9NTQ9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GJB4Q9NTQ9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GJB4Q9NTQ9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
GJB4Q9NTQ9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GJB4Q9NTQ9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GJB4Q9NTQ9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GJB4Q9NTQ9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GJB4Q9NTQ9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GJB4Q9NTQ9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GJB4Q9NTQ9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GJB4Q9NTQ9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GJB4Q9NTQ9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GJB4Q9NTQ9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GJB4Q9NTQ9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
GJB4Q9NTQ9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GJB4Q9NTQ9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GJB4Q9NTQ9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GJB4Q9NTQ9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GJB4Q9NTQ9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GJB4Q9NTQ9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GJB4Q9NTQ9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GJB4Q9NTQ9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GJB4Q9NTQ9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GJB4Q9NTQ9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GJB4Q9NTQ9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GJB4Q9NTQ9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GJB4Q9NTQ9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
GJB4Q9NTQ9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GJB4Q9NTQ9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GJB4Q9NTQ9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GJB4Q9NTQ9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GJB4Q9NTQ9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GJB4Q9NTQ9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GJB4Q9NTQ9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GJB4Q9NTQ9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GJB4Q9NTQ9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GJB4Q9NTQ9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GJB4Q9NTQ9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GJB4Q9NTQ9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GJB4Q9NTQ9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GJB4Q9NTQ9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GJB4Q9NTQ9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GJB4Q9NTQ9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GJB4Q9NTQ9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GJB4Q9NTQ9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GJB4Q9NTQ9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GJB4Q9NTQ9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GJB4Q9NTQ9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GJB4Q9NTQ9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
GJB4Q9NTQ9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GJB4Q9NTQ9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GJB4Q9NTQ9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GJB4Q9NTQ9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GJB4Q9NTQ9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GJB4Q9NTQ9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
GJB4Q9NTQ9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GJB4Q9NTQ9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
GJB4Q9NTQ9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GJB4Q9NTQ9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GJB4Q9NTQ9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
GJB4Q9NTQ9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GJB4Q9NTQ9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GJB4Q9NTQ9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GJB4Q9NTQ9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GJB4Q9NTQ9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
GJB4Q9NTQ9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GJB4Q9NTQ9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GJB4Q9NTQ9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GJB4Q9NTQ9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GJB4Q9NTQ9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GJB4Q9NTQ9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GJB4Q9NTQ9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GJB4Q9NTQ9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GJB4Q9NTQ9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GJB4Q9NTQ9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GJB4Q9NTQ9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
GJB4Q9NTQ9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GJB4Q9NTQ9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GJB4Q9NTQ9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
GJB4Q9NTQ9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GJB4Q9NTQ9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GJB4Q9NTQ9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GJB4Q9NTQ9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GJB4Q9NTQ9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GJB4Q9NTQ9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GJB4Q9NTQ9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GJB4Q9NTQ9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GJB4Q9NTQ9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GJB4Q9NTQ9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GJB4Q9NTQ9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GJB4Q9NTQ9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GJB4Q9NTQ9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
GJB4Q9NTQ9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GJB4Q9NTQ9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GJB4Q9NTQ9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
GJB4Q9NTQ9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
GJB4Q9NTQ9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 211.4 ms