Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

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Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARHGEF4Q9NR80 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARHGEF4Q9NR80 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARHGEF4Q9NR80 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARHGEF4Q9NR80 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARHGEF4Q9NR80 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARHGEF4Q9NR80 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARHGEF4Q9NR80 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ARHGEF4Q9NR80 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARHGEF4Q9NR80 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ARHGEF4Q9NR80 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARHGEF4Q9NR80 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARHGEF4Q9NR80 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARHGEF4Q9NR80 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARHGEF4Q9NR80 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARHGEF4Q9NR80 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARHGEF4Q9NR80 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARHGEF4Q9NR80 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARHGEF4Q9NR80 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARHGEF4Q9NR80 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARHGEF4Q9NR80 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARHGEF4Q9NR80 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARHGEF4Q9NR80 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARHGEF4Q9NR80 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARHGEF4Q9NR80 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARHGEF4Q9NR80 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARHGEF4Q9NR80 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARHGEF4Q9NR80 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARHGEF4Q9NR80 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARHGEF4Q9NR80 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARHGEF4Q9NR80 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARHGEF4Q9NR80 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARHGEF4Q9NR80 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARHGEF4Q9NR80 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARHGEF4Q9NR80 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ARHGEF4Q9NR80 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARHGEF4Q9NR80 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARHGEF4Q9NR80 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARHGEF4Q9NR80 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ARHGEF4Q9NR80 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARHGEF4Q9NR80 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARHGEF4Q9NR80 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARHGEF4Q9NR80 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARHGEF4Q9NR80 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARHGEF4Q9NR80 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARHGEF4Q9NR80 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARHGEF4Q9NR80 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARHGEF4Q9NR80 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARHGEF4Q9NR80 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARHGEF4Q9NR80 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARHGEF4Q9NR80 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARHGEF4Q9NR80 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARHGEF4Q9NR80 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARHGEF4Q9NR80 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARHGEF4Q9NR80 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARHGEF4Q9NR80 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARHGEF4Q9NR80 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARHGEF4Q9NR80 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARHGEF4Q9NR80 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARHGEF4Q9NR80 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARHGEF4Q9NR80 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARHGEF4Q9NR80 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARHGEF4Q9NR80 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ARHGEF4Q9NR80 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARHGEF4Q9NR80 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGEF4Q9NR80 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGEF4Q9NR80 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGEF4Q9NR80 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGEF4Q9NR80 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARHGEF4Q9NR80 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARHGEF4Q9NR80 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARHGEF4Q9NR80 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARHGEF4Q9NR80 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARHGEF4Q9NR80 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARHGEF4Q9NR80 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARHGEF4Q9NR80 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARHGEF4Q9NR80 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARHGEF4Q9NR80 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARHGEF4Q9NR80 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARHGEF4Q9NR80 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARHGEF4Q9NR80 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARHGEF4Q9NR80 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARHGEF4Q9NR80 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARHGEF4Q9NR80 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARHGEF4Q9NR80 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARHGEF4Q9NR80 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF4Q9NR80 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF4Q9NR80 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF4Q9NR80 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF4Q9NR80 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF4Q9NR80 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF4Q9NR80 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF4Q9NR80 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF4Q9NR80 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ARHGEF4Q9NR80 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ARHGEF4Q9NR80 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARHGEF4Q9NR80 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARHGEF4Q9NR80 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARHGEF4Q9NR80 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARHGEF4Q9NR80 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
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