Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CYLDQ9NQC7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CYLDQ9NQC7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CYLDQ9NQC7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CYLDQ9NQC7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CYLDQ9NQC7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CYLDQ9NQC7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYLDQ9NQC7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYLDQ9NQC7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYLDQ9NQC7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYLDQ9NQC7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYLDQ9NQC7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYLDQ9NQC7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CYLDQ9NQC7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CYLDQ9NQC7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CYLDQ9NQC7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
CYLDQ9NQC7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYLDQ9NQC7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYLDQ9NQC7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CYLDQ9NQC7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CYLDQ9NQC7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CYLDQ9NQC7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CYLDQ9NQC7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CYLDQ9NQC7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CYLDQ9NQC7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CYLDQ9NQC7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CYLDQ9NQC7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CYLDQ9NQC7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CYLDQ9NQC7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CYLDQ9NQC7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CYLDQ9NQC7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CYLDQ9NQC7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CYLDQ9NQC7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CYLDQ9NQC7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CYLDQ9NQC7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CYLDQ9NQC7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CYLDQ9NQC7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CYLDQ9NQC7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CYLDQ9NQC7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CYLDQ9NQC7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CYLDQ9NQC7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CYLDQ9NQC7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CYLDQ9NQC7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CYLDQ9NQC7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CYLDQ9NQC7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CYLDQ9NQC7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CYLDQ9NQC7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CYLDQ9NQC7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CYLDQ9NQC7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CYLDQ9NQC7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CYLDQ9NQC7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CYLDQ9NQC7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CYLDQ9NQC7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CYLDQ9NQC7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CYLDQ9NQC7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CYLDQ9NQC7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CYLDQ9NQC7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CYLDQ9NQC7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CYLDQ9NQC7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CYLDQ9NQC7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CYLDQ9NQC7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CYLDQ9NQC7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CYLDQ9NQC7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CYLDQ9NQC7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYLDQ9NQC7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYLDQ9NQC7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYLDQ9NQC7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYLDQ9NQC7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYLDQ9NQC7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYLDQ9NQC7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CYLDQ9NQC7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYLDQ9NQC7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYLDQ9NQC7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYLDQ9NQC7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYLDQ9NQC7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CYLDQ9NQC7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYLDQ9NQC7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CYLDQ9NQC7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYLDQ9NQC7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYLDQ9NQC7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYLDQ9NQC7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYLDQ9NQC7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYLDQ9NQC7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYLDQ9NQC7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYLDQ9NQC7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CYLDQ9NQC7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CYLDQ9NQC7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CYLDQ9NQC7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CYLDQ9NQC7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYLDQ9NQC7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYLDQ9NQC7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYLDQ9NQC7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYLDQ9NQC7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYLDQ9NQC7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CYLDQ9NQC7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CYLDQ9NQC7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CYLDQ9NQC7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CYLDQ9NQC7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CYLDQ9NQC7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CYLDQ9NQC7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
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