Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FZD3Q9NPG1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FZD3Q9NPG1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FZD3Q9NPG1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FZD3Q9NPG1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FZD3Q9NPG1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FZD3Q9NPG1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FZD3Q9NPG1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FZD3Q9NPG1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FZD3Q9NPG1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FZD3Q9NPG1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FZD3Q9NPG1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FZD3Q9NPG1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FZD3Q9NPG1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FZD3Q9NPG1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FZD3Q9NPG1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FZD3Q9NPG1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FZD3Q9NPG1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FZD3Q9NPG1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FZD3Q9NPG1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FZD3Q9NPG1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FZD3Q9NPG1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FZD3Q9NPG1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FZD3Q9NPG1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FZD3Q9NPG1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FZD3Q9NPG1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FZD3Q9NPG1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FZD3Q9NPG1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FZD3Q9NPG1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FZD3Q9NPG1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FZD3Q9NPG1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FZD3Q9NPG1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FZD3Q9NPG1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FZD3Q9NPG1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FZD3Q9NPG1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FZD3Q9NPG1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FZD3Q9NPG1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FZD3Q9NPG1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FZD3Q9NPG1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FZD3Q9NPG1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FZD3Q9NPG1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FZD3Q9NPG1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FZD3Q9NPG1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FZD3Q9NPG1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FZD3Q9NPG1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FZD3Q9NPG1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FZD3Q9NPG1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FZD3Q9NPG1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FZD3Q9NPG1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FZD3Q9NPG1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FZD3Q9NPG1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FZD3Q9NPG1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FZD3Q9NPG1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FZD3Q9NPG1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FZD3Q9NPG1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FZD3Q9NPG1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FZD3Q9NPG1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FZD3Q9NPG1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FZD3Q9NPG1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FZD3Q9NPG1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FZD3Q9NPG1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FZD3Q9NPG1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FZD3Q9NPG1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
FZD3Q9NPG1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FZD3Q9NPG1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FZD3Q9NPG1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FZD3Q9NPG1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FZD3Q9NPG1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FZD3Q9NPG1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FZD3Q9NPG1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FZD3Q9NPG1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FZD3Q9NPG1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FZD3Q9NPG1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FZD3Q9NPG1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FZD3Q9NPG1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FZD3Q9NPG1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FZD3Q9NPG1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FZD3Q9NPG1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FZD3Q9NPG1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FZD3Q9NPG1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FZD3Q9NPG1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FZD3Q9NPG1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
FZD3Q9NPG1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FZD3Q9NPG1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FZD3Q9NPG1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FZD3Q9NPG1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FZD3Q9NPG1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FZD3Q9NPG1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FZD3Q9NPG1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FZD3Q9NPG1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
FZD3Q9NPG1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FZD3Q9NPG1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FZD3Q9NPG1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FZD3Q9NPG1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FZD3Q9NPG1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
FZD3Q9NPG1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FZD3Q9NPG1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FZD3Q9NPG1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FZD3Q9NPG1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FZD3Q9NPG1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms