Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TUFT1Q9NNX1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TUFT1Q9NNX1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TUFT1Q9NNX1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
TUFT1Q9NNX1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TUFT1Q9NNX1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TUFT1Q9NNX1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TUFT1Q9NNX1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TUFT1Q9NNX1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TUFT1Q9NNX1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TUFT1Q9NNX1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
TUFT1Q9NNX1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
TUFT1Q9NNX1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TUFT1Q9NNX1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TUFT1Q9NNX1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TUFT1Q9NNX1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TUFT1Q9NNX1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TUFT1Q9NNX1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TUFT1Q9NNX1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TUFT1Q9NNX1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TUFT1Q9NNX1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TUFT1Q9NNX1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TUFT1Q9NNX1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TUFT1Q9NNX1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TUFT1Q9NNX1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TUFT1Q9NNX1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TUFT1Q9NNX1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TUFT1Q9NNX1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TUFT1Q9NNX1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TUFT1Q9NNX1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TUFT1Q9NNX1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TUFT1Q9NNX1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TUFT1Q9NNX1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TUFT1Q9NNX1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TUFT1Q9NNX1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TUFT1Q9NNX1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TUFT1Q9NNX1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TUFT1Q9NNX1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TUFT1Q9NNX1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TUFT1Q9NNX1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TUFT1Q9NNX1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TUFT1Q9NNX1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TUFT1Q9NNX1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TUFT1Q9NNX1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TUFT1Q9NNX1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TUFT1Q9NNX1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TUFT1Q9NNX1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TUFT1Q9NNX1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TUFT1Q9NNX1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TUFT1Q9NNX1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TUFT1Q9NNX1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TUFT1Q9NNX1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TUFT1Q9NNX1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TUFT1Q9NNX1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TUFT1Q9NNX1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TUFT1Q9NNX1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TUFT1Q9NNX1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TUFT1Q9NNX1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TUFT1Q9NNX1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TUFT1Q9NNX1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TUFT1Q9NNX1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TUFT1Q9NNX1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TUFT1Q9NNX1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TUFT1Q9NNX1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TUFT1Q9NNX1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TUFT1Q9NNX1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TUFT1Q9NNX1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TUFT1Q9NNX1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TUFT1Q9NNX1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TUFT1Q9NNX1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TUFT1Q9NNX1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TUFT1Q9NNX1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TUFT1Q9NNX1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TUFT1Q9NNX1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TUFT1Q9NNX1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TUFT1Q9NNX1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TUFT1Q9NNX1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TUFT1Q9NNX1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TUFT1Q9NNX1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TUFT1Q9NNX1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TUFT1Q9NNX1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TUFT1Q9NNX1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TUFT1Q9NNX1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TUFT1Q9NNX1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TUFT1Q9NNX1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TUFT1Q9NNX1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TUFT1Q9NNX1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TUFT1Q9NNX1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TUFT1Q9NNX1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TUFT1Q9NNX1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TUFT1Q9NNX1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TUFT1Q9NNX1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TUFT1Q9NNX1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TUFT1Q9NNX1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TUFT1Q9NNX1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TUFT1Q9NNX1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TUFT1Q9NNX1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TUFT1Q9NNX1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TUFT1Q9NNX1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TUFT1Q9NNX1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms