Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU8

POLD4, DNA polymerase delta subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD4Q9HCU8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
POLD4Q9HCU8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
POLD4Q9HCU8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
POLD4Q9HCU8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLD4Q9HCU8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLD4Q9HCU8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLD4Q9HCU8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLD4Q9HCU8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLD4Q9HCU8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLD4Q9HCU8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLD4Q9HCU8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLD4Q9HCU8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLD4Q9HCU8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLD4Q9HCU8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLD4Q9HCU8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLD4Q9HCU8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLD4Q9HCU8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLD4Q9HCU8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLD4Q9HCU8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLD4Q9HCU8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
POLD4Q9HCU8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLD4Q9HCU8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLD4Q9HCU8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLD4Q9HCU8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLD4Q9HCU8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLD4Q9HCU8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
POLD4Q9HCU8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLD4Q9HCU8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLD4Q9HCU8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLD4Q9HCU8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLD4Q9HCU8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLD4Q9HCU8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLD4Q9HCU8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLD4Q9HCU8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLD4Q9HCU8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLD4Q9HCU8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLD4Q9HCU8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLD4Q9HCU8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLD4Q9HCU8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLD4Q9HCU8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLD4Q9HCU8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLD4Q9HCU8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLD4Q9HCU8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLD4Q9HCU8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLD4Q9HCU8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLD4Q9HCU8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLD4Q9HCU8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLD4Q9HCU8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLD4Q9HCU8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLD4Q9HCU8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
POLD4Q9HCU8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLD4Q9HCU8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLD4Q9HCU8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLD4Q9HCU8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLD4Q9HCU8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLD4Q9HCU8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLD4Q9HCU8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLD4Q9HCU8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLD4Q9HCU8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
POLD4Q9HCU8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
POLD4Q9HCU8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLD4Q9HCU8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLD4Q9HCU8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLD4Q9HCU8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLD4Q9HCU8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLD4Q9HCU8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLD4Q9HCU8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLD4Q9HCU8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLD4Q9HCU8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLD4Q9HCU8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLD4Q9HCU8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLD4Q9HCU8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLD4Q9HCU8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLD4Q9HCU8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLD4Q9HCU8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLD4Q9HCU8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLD4Q9HCU8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLD4Q9HCU8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
POLD4Q9HCU8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
POLD4Q9HCU8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
POLD4Q9HCU8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLD4Q9HCU8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLD4Q9HCU8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLD4Q9HCU8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLD4Q9HCU8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLD4Q9HCU8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLD4Q9HCU8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLD4Q9HCU8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLD4Q9HCU8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
POLD4Q9HCU8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLD4Q9HCU8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLD4Q9HCU8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLD4Q9HCU8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLD4Q9HCU8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLD4Q9HCU8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLD4Q9HCU8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLD4Q9HCU8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLD4Q9HCU8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLD4Q9HCU8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
POLD4Q9HCU8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms