Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCN6

GP6, Platelet glycoprotein VI, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP6Q9HCN6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GP6Q9HCN6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GP6Q9HCN6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GP6Q9HCN6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GP6Q9HCN6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GP6Q9HCN6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GP6Q9HCN6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GP6Q9HCN6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GP6Q9HCN6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GP6Q9HCN6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GP6Q9HCN6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GP6Q9HCN6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GP6Q9HCN6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GP6Q9HCN6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GP6Q9HCN6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GP6Q9HCN6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GP6Q9HCN6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GP6Q9HCN6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GP6Q9HCN6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GP6Q9HCN6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GP6Q9HCN6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GP6Q9HCN6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GP6Q9HCN6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GP6Q9HCN6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GP6Q9HCN6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GP6Q9HCN6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
GP6Q9HCN6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GP6Q9HCN6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GP6Q9HCN6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GP6Q9HCN6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GP6Q9HCN6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GP6Q9HCN6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GP6Q9HCN6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GP6Q9HCN6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GP6Q9HCN6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GP6Q9HCN6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GP6Q9HCN6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GP6Q9HCN6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GP6Q9HCN6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GP6Q9HCN6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GP6Q9HCN6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GP6Q9HCN6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GP6Q9HCN6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GP6Q9HCN6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GP6Q9HCN6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GP6Q9HCN6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GP6Q9HCN6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GP6Q9HCN6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GP6Q9HCN6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GP6Q9HCN6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GP6Q9HCN6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GP6Q9HCN6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GP6Q9HCN6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GP6Q9HCN6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GP6Q9HCN6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GP6Q9HCN6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GP6Q9HCN6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GP6Q9HCN6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GP6Q9HCN6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GP6Q9HCN6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GP6Q9HCN6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GP6Q9HCN6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GP6Q9HCN6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GP6Q9HCN6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GP6Q9HCN6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GP6Q9HCN6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GP6Q9HCN6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GP6Q9HCN6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GP6Q9HCN6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GP6Q9HCN6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GP6Q9HCN6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GP6Q9HCN6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GP6Q9HCN6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GP6Q9HCN6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GP6Q9HCN6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GP6Q9HCN6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GP6Q9HCN6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GP6Q9HCN6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GP6Q9HCN6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GP6Q9HCN6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GP6Q9HCN6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GP6Q9HCN6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GP6Q9HCN6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GP6Q9HCN6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GP6Q9HCN6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GP6Q9HCN6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GP6Q9HCN6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GP6Q9HCN6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GP6Q9HCN6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GP6Q9HCN6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GP6Q9HCN6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GP6Q9HCN6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GP6Q9HCN6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GP6Q9HCN6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GP6Q9HCN6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GP6Q9HCN6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GP6Q9HCN6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GP6Q9HCN6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GP6Q9HCN6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GP6Q9HCN6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms