Protein–RNA interactions for Protein: Q9H902

REEP1, Receptor expression-enhancing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP1Q9H902 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
REEP1Q9H902 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
REEP1Q9H902 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
REEP1Q9H902 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
REEP1Q9H902 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
REEP1Q9H902 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
REEP1Q9H902 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
REEP1Q9H902 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
REEP1Q9H902 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
REEP1Q9H902 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
REEP1Q9H902 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
REEP1Q9H902 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
REEP1Q9H902 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
REEP1Q9H902 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
REEP1Q9H902 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
REEP1Q9H902 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
REEP1Q9H902 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
REEP1Q9H902 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
REEP1Q9H902 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
REEP1Q9H902 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
REEP1Q9H902 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
REEP1Q9H902 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
REEP1Q9H902 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
REEP1Q9H902 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
REEP1Q9H902 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
REEP1Q9H902 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
REEP1Q9H902 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
REEP1Q9H902 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
REEP1Q9H902 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
REEP1Q9H902 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
REEP1Q9H902 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
REEP1Q9H902 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
REEP1Q9H902 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
REEP1Q9H902 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
REEP1Q9H902 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
REEP1Q9H902 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
REEP1Q9H902 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
REEP1Q9H902 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
REEP1Q9H902 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
REEP1Q9H902 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
REEP1Q9H902 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
REEP1Q9H902 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
REEP1Q9H902 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
REEP1Q9H902 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
REEP1Q9H902 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
REEP1Q9H902 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
REEP1Q9H902 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
REEP1Q9H902 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
REEP1Q9H902 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
REEP1Q9H902 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
REEP1Q9H902 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
REEP1Q9H902 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
REEP1Q9H902 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
REEP1Q9H902 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
REEP1Q9H902 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
REEP1Q9H902 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
REEP1Q9H902 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
REEP1Q9H902 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
REEP1Q9H902 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
REEP1Q9H902 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
REEP1Q9H902 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
REEP1Q9H902 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
REEP1Q9H902 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
REEP1Q9H902 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
REEP1Q9H902 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
REEP1Q9H902 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
REEP1Q9H902 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
REEP1Q9H902 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
REEP1Q9H902 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
REEP1Q9H902 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
REEP1Q9H902 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
REEP1Q9H902 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
REEP1Q9H902 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
REEP1Q9H902 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
REEP1Q9H902 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
REEP1Q9H902 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
REEP1Q9H902 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
REEP1Q9H902 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
REEP1Q9H902 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
REEP1Q9H902 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
REEP1Q9H902 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
REEP1Q9H902 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
REEP1Q9H902 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
REEP1Q9H902 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
REEP1Q9H902 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
REEP1Q9H902 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
REEP1Q9H902 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
REEP1Q9H902 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
REEP1Q9H902 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
REEP1Q9H902 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
REEP1Q9H902 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
REEP1Q9H902 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
REEP1Q9H902 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
REEP1Q9H902 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
REEP1Q9H902 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
REEP1Q9H902 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
REEP1Q9H902 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
REEP1Q9H902 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
REEP1Q9H902 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
REEP1Q9H902 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms