Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B2

RPF2, Ribosome production factor 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPF2Q9H7B2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RPF2Q9H7B2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPF2Q9H7B2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPF2Q9H7B2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPF2Q9H7B2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPF2Q9H7B2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPF2Q9H7B2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPF2Q9H7B2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RPF2Q9H7B2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPF2Q9H7B2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPF2Q9H7B2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPF2Q9H7B2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPF2Q9H7B2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPF2Q9H7B2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPF2Q9H7B2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPF2Q9H7B2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPF2Q9H7B2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RPF2Q9H7B2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPF2Q9H7B2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPF2Q9H7B2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPF2Q9H7B2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPF2Q9H7B2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPF2Q9H7B2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPF2Q9H7B2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPF2Q9H7B2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPF2Q9H7B2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPF2Q9H7B2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPF2Q9H7B2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPF2Q9H7B2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RPF2Q9H7B2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RPF2Q9H7B2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPF2Q9H7B2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPF2Q9H7B2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPF2Q9H7B2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RPF2Q9H7B2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPF2Q9H7B2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPF2Q9H7B2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPF2Q9H7B2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPF2Q9H7B2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPF2Q9H7B2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPF2Q9H7B2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPF2Q9H7B2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPF2Q9H7B2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPF2Q9H7B2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPF2Q9H7B2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPF2Q9H7B2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPF2Q9H7B2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPF2Q9H7B2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPF2Q9H7B2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPF2Q9H7B2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPF2Q9H7B2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPF2Q9H7B2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPF2Q9H7B2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPF2Q9H7B2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPF2Q9H7B2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RPF2Q9H7B2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPF2Q9H7B2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPF2Q9H7B2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPF2Q9H7B2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPF2Q9H7B2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPF2Q9H7B2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPF2Q9H7B2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPF2Q9H7B2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPF2Q9H7B2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPF2Q9H7B2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPF2Q9H7B2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPF2Q9H7B2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPF2Q9H7B2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPF2Q9H7B2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPF2Q9H7B2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPF2Q9H7B2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPF2Q9H7B2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPF2Q9H7B2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPF2Q9H7B2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPF2Q9H7B2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPF2Q9H7B2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPF2Q9H7B2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPF2Q9H7B2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPF2Q9H7B2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPF2Q9H7B2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPF2Q9H7B2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPF2Q9H7B2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPF2Q9H7B2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPF2Q9H7B2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPF2Q9H7B2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPF2Q9H7B2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPF2Q9H7B2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPF2Q9H7B2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPF2Q9H7B2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RPF2Q9H7B2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPF2Q9H7B2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPF2Q9H7B2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPF2Q9H7B2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPF2Q9H7B2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPF2Q9H7B2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPF2Q9H7B2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPF2Q9H7B2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPF2Q9H7B2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPF2Q9H7B2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPF2Q9H7B2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms