Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRDM12Q9H4Q4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRDM12Q9H4Q4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRDM12Q9H4Q4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRDM12Q9H4Q4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRDM12Q9H4Q4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRDM12Q9H4Q4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRDM12Q9H4Q4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRDM12Q9H4Q4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRDM12Q9H4Q4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRDM12Q9H4Q4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PRDM12Q9H4Q4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRDM12Q9H4Q4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRDM12Q9H4Q4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRDM12Q9H4Q4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRDM12Q9H4Q4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRDM12Q9H4Q4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRDM12Q9H4Q4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRDM12Q9H4Q4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PRDM12Q9H4Q4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRDM12Q9H4Q4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRDM12Q9H4Q4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRDM12Q9H4Q4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRDM12Q9H4Q4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRDM12Q9H4Q4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRDM12Q9H4Q4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRDM12Q9H4Q4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRDM12Q9H4Q4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRDM12Q9H4Q4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRDM12Q9H4Q4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRDM12Q9H4Q4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRDM12Q9H4Q4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRDM12Q9H4Q4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRDM12Q9H4Q4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PRDM12Q9H4Q4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRDM12Q9H4Q4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PRDM12Q9H4Q4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRDM12Q9H4Q4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRDM12Q9H4Q4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRDM12Q9H4Q4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRDM12Q9H4Q4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRDM12Q9H4Q4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRDM12Q9H4Q4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRDM12Q9H4Q4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRDM12Q9H4Q4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRDM12Q9H4Q4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRDM12Q9H4Q4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRDM12Q9H4Q4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRDM12Q9H4Q4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRDM12Q9H4Q4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRDM12Q9H4Q4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRDM12Q9H4Q4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRDM12Q9H4Q4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PRDM12Q9H4Q4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PRDM12Q9H4Q4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PRDM12Q9H4Q4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRDM12Q9H4Q4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRDM12Q9H4Q4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRDM12Q9H4Q4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PRDM12Q9H4Q4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRDM12Q9H4Q4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRDM12Q9H4Q4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PRDM12Q9H4Q4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRDM12Q9H4Q4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRDM12Q9H4Q4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRDM12Q9H4Q4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRDM12Q9H4Q4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRDM12Q9H4Q4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRDM12Q9H4Q4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PRDM12Q9H4Q4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRDM12Q9H4Q4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PRDM12Q9H4Q4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRDM12Q9H4Q4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRDM12Q9H4Q4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PRDM12Q9H4Q4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRDM12Q9H4Q4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRDM12Q9H4Q4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRDM12Q9H4Q4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PRDM12Q9H4Q4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRDM12Q9H4Q4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PRDM12Q9H4Q4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PRDM12Q9H4Q4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PRDM12Q9H4Q4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRDM12Q9H4Q4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PRDM12Q9H4Q4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRDM12Q9H4Q4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PRDM12Q9H4Q4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRDM12Q9H4Q4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
PRDM12Q9H4Q4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PRDM12Q9H4Q4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PRDM12Q9H4Q4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRDM12Q9H4Q4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRDM12Q9H4Q4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRDM12Q9H4Q4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRDM12Q9H4Q4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PRDM12Q9H4Q4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PRDM12Q9H4Q4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PRDM12Q9H4Q4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRDM12Q9H4Q4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.51■■■□□ 2
PRDM12Q9H4Q4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms