Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3W5

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3Q9H3W5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRN3Q9H3W5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRN3Q9H3W5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRN3Q9H3W5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRN3Q9H3W5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRN3Q9H3W5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRN3Q9H3W5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRN3Q9H3W5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRN3Q9H3W5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRN3Q9H3W5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRN3Q9H3W5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRN3Q9H3W5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRN3Q9H3W5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRN3Q9H3W5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRN3Q9H3W5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRN3Q9H3W5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRN3Q9H3W5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRN3Q9H3W5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRN3Q9H3W5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRN3Q9H3W5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRN3Q9H3W5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRN3Q9H3W5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRN3Q9H3W5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRN3Q9H3W5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRN3Q9H3W5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRN3Q9H3W5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRN3Q9H3W5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRN3Q9H3W5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRN3Q9H3W5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRN3Q9H3W5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRN3Q9H3W5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRN3Q9H3W5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRN3Q9H3W5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRN3Q9H3W5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRN3Q9H3W5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRN3Q9H3W5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRN3Q9H3W5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRN3Q9H3W5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRN3Q9H3W5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRN3Q9H3W5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRN3Q9H3W5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRN3Q9H3W5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRRN3Q9H3W5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRRN3Q9H3W5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRN3Q9H3W5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRN3Q9H3W5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRN3Q9H3W5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRN3Q9H3W5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRN3Q9H3W5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRN3Q9H3W5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRN3Q9H3W5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRN3Q9H3W5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRN3Q9H3W5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRN3Q9H3W5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRN3Q9H3W5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRN3Q9H3W5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRN3Q9H3W5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRN3Q9H3W5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRN3Q9H3W5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRN3Q9H3W5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRN3Q9H3W5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRN3Q9H3W5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRN3Q9H3W5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRN3Q9H3W5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRN3Q9H3W5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRN3Q9H3W5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRN3Q9H3W5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRN3Q9H3W5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRN3Q9H3W5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRN3Q9H3W5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRN3Q9H3W5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRN3Q9H3W5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRN3Q9H3W5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRN3Q9H3W5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRN3Q9H3W5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRN3Q9H3W5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRN3Q9H3W5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRN3Q9H3W5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRN3Q9H3W5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRN3Q9H3W5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRN3Q9H3W5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRN3Q9H3W5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRN3Q9H3W5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRN3Q9H3W5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRN3Q9H3W5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRN3Q9H3W5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRN3Q9H3W5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRN3Q9H3W5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRN3Q9H3W5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRN3Q9H3W5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRN3Q9H3W5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRN3Q9H3W5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRN3Q9H3W5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRN3Q9H3W5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRN3Q9H3W5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRN3Q9H3W5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRN3Q9H3W5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRN3Q9H3W5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRN3Q9H3W5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRN3Q9H3W5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms