Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3T3

SEMA6B, Semaphorin-6B, humanhuman

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6BQ9H3T3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SEMA6BQ9H3T3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SEMA6BQ9H3T3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SEMA6BQ9H3T3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SEMA6BQ9H3T3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SEMA6BQ9H3T3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SEMA6BQ9H3T3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SEMA6BQ9H3T3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SEMA6BQ9H3T3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SEMA6BQ9H3T3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SEMA6BQ9H3T3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SEMA6BQ9H3T3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SEMA6BQ9H3T3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SEMA6BQ9H3T3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SEMA6BQ9H3T3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SEMA6BQ9H3T3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SEMA6BQ9H3T3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SEMA6BQ9H3T3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SEMA6BQ9H3T3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SEMA6BQ9H3T3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SEMA6BQ9H3T3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SEMA6BQ9H3T3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SEMA6BQ9H3T3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SEMA6BQ9H3T3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SEMA6BQ9H3T3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SEMA6BQ9H3T3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SEMA6BQ9H3T3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SEMA6BQ9H3T3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SEMA6BQ9H3T3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SEMA6BQ9H3T3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SEMA6BQ9H3T3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SEMA6BQ9H3T3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SEMA6BQ9H3T3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SEMA6BQ9H3T3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SEMA6BQ9H3T3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SEMA6BQ9H3T3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SEMA6BQ9H3T3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SEMA6BQ9H3T3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SEMA6BQ9H3T3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SEMA6BQ9H3T3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SEMA6BQ9H3T3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SEMA6BQ9H3T3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SEMA6BQ9H3T3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SEMA6BQ9H3T3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SEMA6BQ9H3T3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SEMA6BQ9H3T3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SEMA6BQ9H3T3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SEMA6BQ9H3T3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SEMA6BQ9H3T3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SEMA6BQ9H3T3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SEMA6BQ9H3T3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SEMA6BQ9H3T3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SEMA6BQ9H3T3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SEMA6BQ9H3T3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SEMA6BQ9H3T3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SEMA6BQ9H3T3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SEMA6BQ9H3T3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SEMA6BQ9H3T3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SEMA6BQ9H3T3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SEMA6BQ9H3T3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SEMA6BQ9H3T3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SEMA6BQ9H3T3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SEMA6BQ9H3T3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SEMA6BQ9H3T3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SEMA6BQ9H3T3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SEMA6BQ9H3T3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SEMA6BQ9H3T3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SEMA6BQ9H3T3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SEMA6BQ9H3T3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SEMA6BQ9H3T3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SEMA6BQ9H3T3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SEMA6BQ9H3T3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SEMA6BQ9H3T3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SEMA6BQ9H3T3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SEMA6BQ9H3T3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SEMA6BQ9H3T3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SEMA6BQ9H3T3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SEMA6BQ9H3T3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SEMA6BQ9H3T3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SEMA6BQ9H3T3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SEMA6BQ9H3T3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SEMA6BQ9H3T3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SEMA6BQ9H3T3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SEMA6BQ9H3T3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SEMA6BQ9H3T3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SEMA6BQ9H3T3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SEMA6BQ9H3T3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SEMA6BQ9H3T3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SEMA6BQ9H3T3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SEMA6BQ9H3T3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SEMA6BQ9H3T3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SEMA6BQ9H3T3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SEMA6BQ9H3T3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SEMA6BQ9H3T3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SEMA6BQ9H3T3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SEMA6BQ9H3T3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SEMA6BQ9H3T3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SEMA6BQ9H3T3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SEMA6BQ9H3T3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SEMA6BQ9H3T3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms