Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3S4

TPK1, Thiamin pyrophosphokinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPK1Q9H3S4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPK1Q9H3S4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPK1Q9H3S4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPK1Q9H3S4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPK1Q9H3S4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPK1Q9H3S4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPK1Q9H3S4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPK1Q9H3S4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPK1Q9H3S4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPK1Q9H3S4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPK1Q9H3S4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPK1Q9H3S4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPK1Q9H3S4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPK1Q9H3S4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPK1Q9H3S4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPK1Q9H3S4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPK1Q9H3S4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPK1Q9H3S4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPK1Q9H3S4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPK1Q9H3S4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPK1Q9H3S4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TPK1Q9H3S4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
TPK1Q9H3S4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TPK1Q9H3S4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TPK1Q9H3S4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPK1Q9H3S4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPK1Q9H3S4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPK1Q9H3S4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPK1Q9H3S4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPK1Q9H3S4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPK1Q9H3S4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPK1Q9H3S4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPK1Q9H3S4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPK1Q9H3S4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPK1Q9H3S4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPK1Q9H3S4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPK1Q9H3S4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPK1Q9H3S4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPK1Q9H3S4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPK1Q9H3S4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TPK1Q9H3S4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPK1Q9H3S4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPK1Q9H3S4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPK1Q9H3S4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPK1Q9H3S4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPK1Q9H3S4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPK1Q9H3S4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPK1Q9H3S4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPK1Q9H3S4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPK1Q9H3S4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPK1Q9H3S4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPK1Q9H3S4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPK1Q9H3S4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPK1Q9H3S4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPK1Q9H3S4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TPK1Q9H3S4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPK1Q9H3S4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPK1Q9H3S4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TPK1Q9H3S4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPK1Q9H3S4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPK1Q9H3S4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPK1Q9H3S4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPK1Q9H3S4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPK1Q9H3S4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TPK1Q9H3S4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPK1Q9H3S4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPK1Q9H3S4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPK1Q9H3S4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPK1Q9H3S4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPK1Q9H3S4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPK1Q9H3S4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPK1Q9H3S4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPK1Q9H3S4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPK1Q9H3S4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPK1Q9H3S4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPK1Q9H3S4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPK1Q9H3S4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPK1Q9H3S4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPK1Q9H3S4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPK1Q9H3S4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPK1Q9H3S4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPK1Q9H3S4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPK1Q9H3S4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPK1Q9H3S4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPK1Q9H3S4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPK1Q9H3S4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPK1Q9H3S4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPK1Q9H3S4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPK1Q9H3S4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPK1Q9H3S4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPK1Q9H3S4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPK1Q9H3S4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPK1Q9H3S4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPK1Q9H3S4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPK1Q9H3S4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPK1Q9H3S4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPK1Q9H3S4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPK1Q9H3S4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPK1Q9H3S4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPK1Q9H3S4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms