Protein–RNA interactions for Protein: Q9H320

VCX, Variable charge X-linked protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCXQ9H320 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VCXQ9H320 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VCXQ9H320 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VCXQ9H320 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VCXQ9H320 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VCXQ9H320 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VCXQ9H320 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VCXQ9H320 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VCXQ9H320 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VCXQ9H320 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VCXQ9H320 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VCXQ9H320 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VCXQ9H320 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VCXQ9H320 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VCXQ9H320 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VCXQ9H320 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VCXQ9H320 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VCXQ9H320 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VCXQ9H320 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VCXQ9H320 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VCXQ9H320 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VCXQ9H320 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VCXQ9H320 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VCXQ9H320 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VCXQ9H320 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
VCXQ9H320 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VCXQ9H320 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VCXQ9H320 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VCXQ9H320 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VCXQ9H320 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VCXQ9H320 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VCXQ9H320 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VCXQ9H320 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VCXQ9H320 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VCXQ9H320 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VCXQ9H320 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VCXQ9H320 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VCXQ9H320 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VCXQ9H320 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VCXQ9H320 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VCXQ9H320 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VCXQ9H320 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VCXQ9H320 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VCXQ9H320 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VCXQ9H320 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VCXQ9H320 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VCXQ9H320 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VCXQ9H320 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VCXQ9H320 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VCXQ9H320 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VCXQ9H320 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VCXQ9H320 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VCXQ9H320 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VCXQ9H320 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VCXQ9H320 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VCXQ9H320 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VCXQ9H320 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VCXQ9H320 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VCXQ9H320 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
VCXQ9H320 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VCXQ9H320 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VCXQ9H320 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VCXQ9H320 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VCXQ9H320 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VCXQ9H320 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VCXQ9H320 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VCXQ9H320 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VCXQ9H320 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VCXQ9H320 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VCXQ9H320 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VCXQ9H320 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VCXQ9H320 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VCXQ9H320 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VCXQ9H320 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VCXQ9H320 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VCXQ9H320 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VCXQ9H320 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VCXQ9H320 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VCXQ9H320 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VCXQ9H320 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
VCXQ9H320 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VCXQ9H320 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VCXQ9H320 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VCXQ9H320 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VCXQ9H320 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VCXQ9H320 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VCXQ9H320 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VCXQ9H320 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VCXQ9H320 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VCXQ9H320 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VCXQ9H320 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VCXQ9H320 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VCXQ9H320 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VCXQ9H320 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VCXQ9H320 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VCXQ9H320 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
VCXQ9H320 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
VCXQ9H320 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VCXQ9H320 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VCXQ9H320 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms