Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0K4

RSPH6A, Radial spoke head protein 6 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH6AQ9H0K4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RSPH6AQ9H0K4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RSPH6AQ9H0K4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RSPH6AQ9H0K4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RSPH6AQ9H0K4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RSPH6AQ9H0K4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RSPH6AQ9H0K4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RSPH6AQ9H0K4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RSPH6AQ9H0K4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RSPH6AQ9H0K4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RSPH6AQ9H0K4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RSPH6AQ9H0K4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
RSPH6AQ9H0K4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.82■■■■□ 3
RSPH6AQ9H0K4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
RSPH6AQ9H0K4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
RSPH6AQ9H0K4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
RSPH6AQ9H0K4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RSPH6AQ9H0K4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
RSPH6AQ9H0K4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
RSPH6AQ9H0K4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
RSPH6AQ9H0K4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
RSPH6AQ9H0K4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.77■■■■□ 3
RSPH6AQ9H0K4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
RSPH6AQ9H0K4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
RSPH6AQ9H0K4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
RSPH6AQ9H0K4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
RSPH6AQ9H0K4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
RSPH6AQ9H0K4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
RSPH6AQ9H0K4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
RSPH6AQ9H0K4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RSPH6AQ9H0K4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RSPH6AQ9H0K4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RSPH6AQ9H0K4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RSPH6AQ9H0K4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RSPH6AQ9H0K4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
RSPH6AQ9H0K4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RSPH6AQ9H0K4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RSPH6AQ9H0K4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RSPH6AQ9H0K4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RSPH6AQ9H0K4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RSPH6AQ9H0K4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
RSPH6AQ9H0K4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RSPH6AQ9H0K4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RSPH6AQ9H0K4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RSPH6AQ9H0K4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RSPH6AQ9H0K4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RSPH6AQ9H0K4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
RSPH6AQ9H0K4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RSPH6AQ9H0K4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RSPH6AQ9H0K4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RSPH6AQ9H0K4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RSPH6AQ9H0K4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RSPH6AQ9H0K4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
RSPH6AQ9H0K4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RSPH6AQ9H0K4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
RSPH6AQ9H0K4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
RSPH6AQ9H0K4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
RSPH6AQ9H0K4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RSPH6AQ9H0K4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RSPH6AQ9H0K4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RSPH6AQ9H0K4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RSPH6AQ9H0K4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RSPH6AQ9H0K4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
RSPH6AQ9H0K4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
RSPH6AQ9H0K4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
RSPH6AQ9H0K4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
RSPH6AQ9H0K4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
RSPH6AQ9H0K4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RSPH6AQ9H0K4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RSPH6AQ9H0K4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RSPH6AQ9H0K4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RSPH6AQ9H0K4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RSPH6AQ9H0K4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
RSPH6AQ9H0K4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
RSPH6AQ9H0K4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RSPH6AQ9H0K4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RSPH6AQ9H0K4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RSPH6AQ9H0K4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
RSPH6AQ9H0K4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RSPH6AQ9H0K4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RSPH6AQ9H0K4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RSPH6AQ9H0K4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RSPH6AQ9H0K4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RSPH6AQ9H0K4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
RSPH6AQ9H0K4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
RSPH6AQ9H0K4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RSPH6AQ9H0K4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RSPH6AQ9H0K4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RSPH6AQ9H0K4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
RSPH6AQ9H0K4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RSPH6AQ9H0K4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
RSPH6AQ9H0K4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
RSPH6AQ9H0K4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
RSPH6AQ9H0K4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
RSPH6AQ9H0K4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
RSPH6AQ9H0K4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RSPH6AQ9H0K4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
RSPH6AQ9H0K4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
RSPH6AQ9H0K4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RSPH6AQ9H0K4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms