Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E9

BRD8, Bromodomain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD8Q9H0E9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRD8Q9H0E9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
BRD8Q9H0E9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRD8Q9H0E9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRD8Q9H0E9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRD8Q9H0E9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRD8Q9H0E9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRD8Q9H0E9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRD8Q9H0E9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRD8Q9H0E9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRD8Q9H0E9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRD8Q9H0E9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
BRD8Q9H0E9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
BRD8Q9H0E9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRD8Q9H0E9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRD8Q9H0E9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRD8Q9H0E9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRD8Q9H0E9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRD8Q9H0E9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRD8Q9H0E9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
BRD8Q9H0E9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRD8Q9H0E9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRD8Q9H0E9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRD8Q9H0E9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRD8Q9H0E9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRD8Q9H0E9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRD8Q9H0E9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRD8Q9H0E9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRD8Q9H0E9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRD8Q9H0E9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
BRD8Q9H0E9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRD8Q9H0E9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRD8Q9H0E9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRD8Q9H0E9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRD8Q9H0E9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRD8Q9H0E9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRD8Q9H0E9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRD8Q9H0E9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRD8Q9H0E9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRD8Q9H0E9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRD8Q9H0E9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRD8Q9H0E9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRD8Q9H0E9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRD8Q9H0E9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRD8Q9H0E9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRD8Q9H0E9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRD8Q9H0E9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRD8Q9H0E9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRD8Q9H0E9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRD8Q9H0E9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRD8Q9H0E9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRD8Q9H0E9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRD8Q9H0E9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRD8Q9H0E9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
BRD8Q9H0E9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRD8Q9H0E9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRD8Q9H0E9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
BRD8Q9H0E9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRD8Q9H0E9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRD8Q9H0E9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRD8Q9H0E9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRD8Q9H0E9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRD8Q9H0E9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRD8Q9H0E9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRD8Q9H0E9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRD8Q9H0E9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRD8Q9H0E9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRD8Q9H0E9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRD8Q9H0E9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRD8Q9H0E9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRD8Q9H0E9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRD8Q9H0E9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRD8Q9H0E9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRD8Q9H0E9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRD8Q9H0E9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRD8Q9H0E9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRD8Q9H0E9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRD8Q9H0E9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRD8Q9H0E9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRD8Q9H0E9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRD8Q9H0E9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRD8Q9H0E9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRD8Q9H0E9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRD8Q9H0E9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRD8Q9H0E9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRD8Q9H0E9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRD8Q9H0E9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRD8Q9H0E9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRD8Q9H0E9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRD8Q9H0E9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRD8Q9H0E9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRD8Q9H0E9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRD8Q9H0E9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRD8Q9H0E9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRD8Q9H0E9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRD8Q9H0E9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRD8Q9H0E9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRD8Q9H0E9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRD8Q9H0E9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRD8Q9H0E9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms