Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD1Q9GZZ0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD1Q9GZZ0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD1Q9GZZ0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD1Q9GZZ0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD1Q9GZZ0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD1Q9GZZ0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD1Q9GZZ0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD1Q9GZZ0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD1Q9GZZ0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD1Q9GZZ0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD1Q9GZZ0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD1Q9GZZ0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD1Q9GZZ0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD1Q9GZZ0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD1Q9GZZ0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXD1Q9GZZ0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXD1Q9GZZ0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXD1Q9GZZ0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXD1Q9GZZ0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXD1Q9GZZ0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXD1Q9GZZ0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXD1Q9GZZ0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXD1Q9GZZ0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXD1Q9GZZ0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXD1Q9GZZ0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXD1Q9GZZ0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXD1Q9GZZ0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXD1Q9GZZ0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXD1Q9GZZ0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXD1Q9GZZ0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXD1Q9GZZ0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXD1Q9GZZ0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXD1Q9GZZ0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXD1Q9GZZ0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD1Q9GZZ0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD1Q9GZZ0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD1Q9GZZ0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD1Q9GZZ0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD1Q9GZZ0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD1Q9GZZ0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD1Q9GZZ0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD1Q9GZZ0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD1Q9GZZ0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD1Q9GZZ0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD1Q9GZZ0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD1Q9GZZ0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD1Q9GZZ0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD1Q9GZZ0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD1Q9GZZ0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD1Q9GZZ0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD1Q9GZZ0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD1Q9GZZ0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD1Q9GZZ0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD1Q9GZZ0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXD1Q9GZZ0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXD1Q9GZZ0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXD1Q9GZZ0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXD1Q9GZZ0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXD1Q9GZZ0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXD1Q9GZZ0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXD1Q9GZZ0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXD1Q9GZZ0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD1Q9GZZ0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD1Q9GZZ0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD1Q9GZZ0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD1Q9GZZ0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXD1Q9GZZ0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXD1Q9GZZ0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXD1Q9GZZ0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXD1Q9GZZ0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXD1Q9GZZ0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXD1Q9GZZ0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXD1Q9GZZ0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD1Q9GZZ0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD1Q9GZZ0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD1Q9GZZ0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD1Q9GZZ0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD1Q9GZZ0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD1Q9GZZ0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD1Q9GZZ0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD1Q9GZZ0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD1Q9GZZ0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXD1Q9GZZ0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXD1Q9GZZ0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXD1Q9GZZ0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXD1Q9GZZ0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD1Q9GZZ0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD1Q9GZZ0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD1Q9GZZ0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD1Q9GZZ0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD1Q9GZZ0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD1Q9GZZ0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD1Q9GZZ0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD1Q9GZZ0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD1Q9GZZ0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD1Q9GZZ0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD1Q9GZZ0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD1Q9GZZ0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD1Q9GZZ0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms