Protein–RNA interactions for Protein: Q9C019

TRIM15, Tripartite motif-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM15Q9C019 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM15Q9C019 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM15Q9C019 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM15Q9C019 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM15Q9C019 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM15Q9C019 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM15Q9C019 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM15Q9C019 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM15Q9C019 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM15Q9C019 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM15Q9C019 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM15Q9C019 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM15Q9C019 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM15Q9C019 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM15Q9C019 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM15Q9C019 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM15Q9C019 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM15Q9C019 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM15Q9C019 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM15Q9C019 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM15Q9C019 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM15Q9C019 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM15Q9C019 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM15Q9C019 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM15Q9C019 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM15Q9C019 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM15Q9C019 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM15Q9C019 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM15Q9C019 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM15Q9C019 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM15Q9C019 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM15Q9C019 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM15Q9C019 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM15Q9C019 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM15Q9C019 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM15Q9C019 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM15Q9C019 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM15Q9C019 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM15Q9C019 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM15Q9C019 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM15Q9C019 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM15Q9C019 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM15Q9C019 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM15Q9C019 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM15Q9C019 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM15Q9C019 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM15Q9C019 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM15Q9C019 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM15Q9C019 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM15Q9C019 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM15Q9C019 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM15Q9C019 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM15Q9C019 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM15Q9C019 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM15Q9C019 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM15Q9C019 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM15Q9C019 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM15Q9C019 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM15Q9C019 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM15Q9C019 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM15Q9C019 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM15Q9C019 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM15Q9C019 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM15Q9C019 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM15Q9C019 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM15Q9C019 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM15Q9C019 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM15Q9C019 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM15Q9C019 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM15Q9C019 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM15Q9C019 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM15Q9C019 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM15Q9C019 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM15Q9C019 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM15Q9C019 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM15Q9C019 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM15Q9C019 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM15Q9C019 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM15Q9C019 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM15Q9C019 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM15Q9C019 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRIM15Q9C019 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRIM15Q9C019 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM15Q9C019 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM15Q9C019 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM15Q9C019 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM15Q9C019 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM15Q9C019 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM15Q9C019 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM15Q9C019 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM15Q9C019 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM15Q9C019 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM15Q9C019 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM15Q9C019 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM15Q9C019 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM15Q9C019 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM15Q9C019 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM15Q9C019 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM15Q9C019 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM15Q9C019 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms