Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM8Q9BZR9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM8Q9BZR9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM8Q9BZR9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM8Q9BZR9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM8Q9BZR9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM8Q9BZR9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM8Q9BZR9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM8Q9BZR9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM8Q9BZR9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM8Q9BZR9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM8Q9BZR9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM8Q9BZR9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM8Q9BZR9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM8Q9BZR9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM8Q9BZR9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM8Q9BZR9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM8Q9BZR9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM8Q9BZR9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM8Q9BZR9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM8Q9BZR9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM8Q9BZR9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM8Q9BZR9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM8Q9BZR9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM8Q9BZR9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM8Q9BZR9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM8Q9BZR9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM8Q9BZR9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM8Q9BZR9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM8Q9BZR9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM8Q9BZR9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM8Q9BZR9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM8Q9BZR9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM8Q9BZR9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM8Q9BZR9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM8Q9BZR9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM8Q9BZR9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM8Q9BZR9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM8Q9BZR9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM8Q9BZR9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM8Q9BZR9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM8Q9BZR9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM8Q9BZR9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM8Q9BZR9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM8Q9BZR9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM8Q9BZR9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM8Q9BZR9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM8Q9BZR9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM8Q9BZR9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM8Q9BZR9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM8Q9BZR9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM8Q9BZR9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM8Q9BZR9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM8Q9BZR9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM8Q9BZR9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM8Q9BZR9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM8Q9BZR9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM8Q9BZR9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM8Q9BZR9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM8Q9BZR9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM8Q9BZR9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM8Q9BZR9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM8Q9BZR9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM8Q9BZR9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM8Q9BZR9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM8Q9BZR9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM8Q9BZR9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM8Q9BZR9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM8Q9BZR9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM8Q9BZR9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM8Q9BZR9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM8Q9BZR9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM8Q9BZR9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM8Q9BZR9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM8Q9BZR9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM8Q9BZR9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM8Q9BZR9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM8Q9BZR9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM8Q9BZR9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM8Q9BZR9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM8Q9BZR9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM8Q9BZR9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM8Q9BZR9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM8Q9BZR9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM8Q9BZR9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM8Q9BZR9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM8Q9BZR9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM8Q9BZR9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM8Q9BZR9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM8Q9BZR9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM8Q9BZR9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM8Q9BZR9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM8Q9BZR9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM8Q9BZR9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM8Q9BZR9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM8Q9BZR9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM8Q9BZR9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM8Q9BZR9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM8Q9BZR9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM8Q9BZR9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms