Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYW2

SETD2, Histone-lysine N-methyltransferase SETD2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD2Q9BYW2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SETD2Q9BYW2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SETD2Q9BYW2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SETD2Q9BYW2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SETD2Q9BYW2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SETD2Q9BYW2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SETD2Q9BYW2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SETD2Q9BYW2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SETD2Q9BYW2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SETD2Q9BYW2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SETD2Q9BYW2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SETD2Q9BYW2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SETD2Q9BYW2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SETD2Q9BYW2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SETD2Q9BYW2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SETD2Q9BYW2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SETD2Q9BYW2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SETD2Q9BYW2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SETD2Q9BYW2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SETD2Q9BYW2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SETD2Q9BYW2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SETD2Q9BYW2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SETD2Q9BYW2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SETD2Q9BYW2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SETD2Q9BYW2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SETD2Q9BYW2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SETD2Q9BYW2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SETD2Q9BYW2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SETD2Q9BYW2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SETD2Q9BYW2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SETD2Q9BYW2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SETD2Q9BYW2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SETD2Q9BYW2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SETD2Q9BYW2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SETD2Q9BYW2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SETD2Q9BYW2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SETD2Q9BYW2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SETD2Q9BYW2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SETD2Q9BYW2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SETD2Q9BYW2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SETD2Q9BYW2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SETD2Q9BYW2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SETD2Q9BYW2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SETD2Q9BYW2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SETD2Q9BYW2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SETD2Q9BYW2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SETD2Q9BYW2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SETD2Q9BYW2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SETD2Q9BYW2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SETD2Q9BYW2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SETD2Q9BYW2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SETD2Q9BYW2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SETD2Q9BYW2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SETD2Q9BYW2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SETD2Q9BYW2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SETD2Q9BYW2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SETD2Q9BYW2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SETD2Q9BYW2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SETD2Q9BYW2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SETD2Q9BYW2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SETD2Q9BYW2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SETD2Q9BYW2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SETD2Q9BYW2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SETD2Q9BYW2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SETD2Q9BYW2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SETD2Q9BYW2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SETD2Q9BYW2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SETD2Q9BYW2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SETD2Q9BYW2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SETD2Q9BYW2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SETD2Q9BYW2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SETD2Q9BYW2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SETD2Q9BYW2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SETD2Q9BYW2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SETD2Q9BYW2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SETD2Q9BYW2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SETD2Q9BYW2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SETD2Q9BYW2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SETD2Q9BYW2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SETD2Q9BYW2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SETD2Q9BYW2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SETD2Q9BYW2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SETD2Q9BYW2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SETD2Q9BYW2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SETD2Q9BYW2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SETD2Q9BYW2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SETD2Q9BYW2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SETD2Q9BYW2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SETD2Q9BYW2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SETD2Q9BYW2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SETD2Q9BYW2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SETD2Q9BYW2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SETD2Q9BYW2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SETD2Q9BYW2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SETD2Q9BYW2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SETD2Q9BYW2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SETD2Q9BYW2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SETD2Q9BYW2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SETD2Q9BYW2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SETD2Q9BYW2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms