Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX67

JAM3, Junctional adhesion molecule C, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAM3Q9BX67 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
JAM3Q9BX67 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
JAM3Q9BX67 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
JAM3Q9BX67 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
JAM3Q9BX67 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
JAM3Q9BX67 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
JAM3Q9BX67 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
JAM3Q9BX67 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
JAM3Q9BX67 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
JAM3Q9BX67 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
JAM3Q9BX67 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
JAM3Q9BX67 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
JAM3Q9BX67 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
JAM3Q9BX67 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
JAM3Q9BX67 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
JAM3Q9BX67 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
JAM3Q9BX67 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
JAM3Q9BX67 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
JAM3Q9BX67 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
JAM3Q9BX67 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
JAM3Q9BX67 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
JAM3Q9BX67 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
JAM3Q9BX67 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
JAM3Q9BX67 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
JAM3Q9BX67 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
JAM3Q9BX67 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
JAM3Q9BX67 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
JAM3Q9BX67 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
JAM3Q9BX67 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
JAM3Q9BX67 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
JAM3Q9BX67 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
JAM3Q9BX67 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
JAM3Q9BX67 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
JAM3Q9BX67 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
JAM3Q9BX67 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
JAM3Q9BX67 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
JAM3Q9BX67 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
JAM3Q9BX67 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
JAM3Q9BX67 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
JAM3Q9BX67 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
JAM3Q9BX67 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
JAM3Q9BX67 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
JAM3Q9BX67 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
JAM3Q9BX67 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
JAM3Q9BX67 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
JAM3Q9BX67 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
JAM3Q9BX67 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
JAM3Q9BX67 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
JAM3Q9BX67 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
JAM3Q9BX67 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
JAM3Q9BX67 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
JAM3Q9BX67 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
JAM3Q9BX67 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
JAM3Q9BX67 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
JAM3Q9BX67 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
JAM3Q9BX67 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
JAM3Q9BX67 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
JAM3Q9BX67 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
JAM3Q9BX67 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
JAM3Q9BX67 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
JAM3Q9BX67 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
JAM3Q9BX67 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
JAM3Q9BX67 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
JAM3Q9BX67 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
JAM3Q9BX67 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
JAM3Q9BX67 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
JAM3Q9BX67 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
JAM3Q9BX67 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
JAM3Q9BX67 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
JAM3Q9BX67 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
JAM3Q9BX67 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
JAM3Q9BX67 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
JAM3Q9BX67 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
JAM3Q9BX67 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
JAM3Q9BX67 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
JAM3Q9BX67 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
JAM3Q9BX67 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
JAM3Q9BX67 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
JAM3Q9BX67 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
JAM3Q9BX67 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
JAM3Q9BX67 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
JAM3Q9BX67 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
JAM3Q9BX67 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
JAM3Q9BX67 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
JAM3Q9BX67 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
JAM3Q9BX67 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
JAM3Q9BX67 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
JAM3Q9BX67 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
JAM3Q9BX67 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
JAM3Q9BX67 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
JAM3Q9BX67 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
JAM3Q9BX67 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
JAM3Q9BX67 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
JAM3Q9BX67 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
JAM3Q9BX67 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
JAM3Q9BX67 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
JAM3Q9BX67 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
JAM3Q9BX67 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
JAM3Q9BX67 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
JAM3Q9BX67 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms