Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVM4

GGACT, Gamma-glutamylaminecyclotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGACTQ9BVM4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GGACTQ9BVM4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GGACTQ9BVM4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GGACTQ9BVM4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GGACTQ9BVM4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GGACTQ9BVM4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GGACTQ9BVM4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GGACTQ9BVM4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GGACTQ9BVM4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GGACTQ9BVM4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GGACTQ9BVM4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GGACTQ9BVM4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GGACTQ9BVM4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GGACTQ9BVM4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GGACTQ9BVM4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GGACTQ9BVM4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GGACTQ9BVM4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GGACTQ9BVM4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GGACTQ9BVM4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GGACTQ9BVM4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GGACTQ9BVM4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GGACTQ9BVM4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GGACTQ9BVM4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GGACTQ9BVM4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GGACTQ9BVM4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GGACTQ9BVM4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GGACTQ9BVM4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GGACTQ9BVM4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GGACTQ9BVM4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GGACTQ9BVM4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GGACTQ9BVM4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GGACTQ9BVM4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GGACTQ9BVM4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GGACTQ9BVM4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GGACTQ9BVM4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GGACTQ9BVM4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GGACTQ9BVM4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GGACTQ9BVM4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GGACTQ9BVM4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GGACTQ9BVM4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GGACTQ9BVM4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GGACTQ9BVM4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GGACTQ9BVM4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GGACTQ9BVM4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GGACTQ9BVM4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GGACTQ9BVM4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GGACTQ9BVM4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GGACTQ9BVM4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GGACTQ9BVM4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GGACTQ9BVM4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GGACTQ9BVM4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GGACTQ9BVM4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GGACTQ9BVM4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GGACTQ9BVM4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GGACTQ9BVM4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GGACTQ9BVM4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGACTQ9BVM4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGACTQ9BVM4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGACTQ9BVM4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGACTQ9BVM4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGACTQ9BVM4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGACTQ9BVM4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGACTQ9BVM4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GGACTQ9BVM4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GGACTQ9BVM4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GGACTQ9BVM4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GGACTQ9BVM4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GGACTQ9BVM4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GGACTQ9BVM4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GGACTQ9BVM4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GGACTQ9BVM4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GGACTQ9BVM4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GGACTQ9BVM4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GGACTQ9BVM4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GGACTQ9BVM4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GGACTQ9BVM4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GGACTQ9BVM4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GGACTQ9BVM4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GGACTQ9BVM4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GGACTQ9BVM4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GGACTQ9BVM4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GGACTQ9BVM4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GGACTQ9BVM4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GGACTQ9BVM4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GGACTQ9BVM4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GGACTQ9BVM4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GGACTQ9BVM4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GGACTQ9BVM4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GGACTQ9BVM4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GGACTQ9BVM4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GGACTQ9BVM4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GGACTQ9BVM4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GGACTQ9BVM4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GGACTQ9BVM4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GGACTQ9BVM4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GGACTQ9BVM4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GGACTQ9BVM4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GGACTQ9BVM4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GGACTQ9BVM4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GGACTQ9BVM4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms