Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV99

LRRC61, Leucine-rich repeat-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC61Q9BV99 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC61Q9BV99 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC61Q9BV99 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC61Q9BV99 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC61Q9BV99 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC61Q9BV99 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC61Q9BV99 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC61Q9BV99 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC61Q9BV99 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC61Q9BV99 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC61Q9BV99 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC61Q9BV99 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC61Q9BV99 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC61Q9BV99 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC61Q9BV99 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC61Q9BV99 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC61Q9BV99 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC61Q9BV99 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC61Q9BV99 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC61Q9BV99 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC61Q9BV99 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC61Q9BV99 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC61Q9BV99 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRRC61Q9BV99 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC61Q9BV99 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC61Q9BV99 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC61Q9BV99 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC61Q9BV99 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC61Q9BV99 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC61Q9BV99 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC61Q9BV99 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC61Q9BV99 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC61Q9BV99 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC61Q9BV99 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC61Q9BV99 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC61Q9BV99 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC61Q9BV99 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC61Q9BV99 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC61Q9BV99 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC61Q9BV99 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC61Q9BV99 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC61Q9BV99 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC61Q9BV99 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC61Q9BV99 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC61Q9BV99 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC61Q9BV99 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC61Q9BV99 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC61Q9BV99 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC61Q9BV99 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC61Q9BV99 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC61Q9BV99 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC61Q9BV99 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC61Q9BV99 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC61Q9BV99 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC61Q9BV99 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC61Q9BV99 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC61Q9BV99 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC61Q9BV99 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC61Q9BV99 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC61Q9BV99 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC61Q9BV99 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC61Q9BV99 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC61Q9BV99 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC61Q9BV99 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC61Q9BV99 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC61Q9BV99 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC61Q9BV99 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC61Q9BV99 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC61Q9BV99 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC61Q9BV99 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC61Q9BV99 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC61Q9BV99 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC61Q9BV99 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC61Q9BV99 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC61Q9BV99 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC61Q9BV99 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC61Q9BV99 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC61Q9BV99 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC61Q9BV99 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC61Q9BV99 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC61Q9BV99 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC61Q9BV99 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC61Q9BV99 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC61Q9BV99 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC61Q9BV99 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC61Q9BV99 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC61Q9BV99 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC61Q9BV99 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC61Q9BV99 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC61Q9BV99 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC61Q9BV99 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC61Q9BV99 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC61Q9BV99 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC61Q9BV99 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC61Q9BV99 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC61Q9BV99 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC61Q9BV99 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC61Q9BV99 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC61Q9BV99 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC61Q9BV99 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms