Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MTA3Q9BTC8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MTA3Q9BTC8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MTA3Q9BTC8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MTA3Q9BTC8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MTA3Q9BTC8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MTA3Q9BTC8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MTA3Q9BTC8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
MTA3Q9BTC8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
MTA3Q9BTC8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
MTA3Q9BTC8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
MTA3Q9BTC8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
MTA3Q9BTC8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MTA3Q9BTC8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MTA3Q9BTC8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
MTA3Q9BTC8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
MTA3Q9BTC8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MTA3Q9BTC8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MTA3Q9BTC8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MTA3Q9BTC8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MTA3Q9BTC8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MTA3Q9BTC8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MTA3Q9BTC8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MTA3Q9BTC8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MTA3Q9BTC8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MTA3Q9BTC8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MTA3Q9BTC8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
MTA3Q9BTC8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MTA3Q9BTC8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MTA3Q9BTC8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MTA3Q9BTC8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MTA3Q9BTC8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MTA3Q9BTC8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MTA3Q9BTC8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MTA3Q9BTC8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
MTA3Q9BTC8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MTA3Q9BTC8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MTA3Q9BTC8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MTA3Q9BTC8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MTA3Q9BTC8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
MTA3Q9BTC8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MTA3Q9BTC8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MTA3Q9BTC8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MTA3Q9BTC8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MTA3Q9BTC8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MTA3Q9BTC8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MTA3Q9BTC8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MTA3Q9BTC8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MTA3Q9BTC8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
MTA3Q9BTC8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
MTA3Q9BTC8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
MTA3Q9BTC8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
MTA3Q9BTC8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
MTA3Q9BTC8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
MTA3Q9BTC8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MTA3Q9BTC8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MTA3Q9BTC8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
MTA3Q9BTC8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MTA3Q9BTC8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MTA3Q9BTC8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
MTA3Q9BTC8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
MTA3Q9BTC8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
MTA3Q9BTC8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
MTA3Q9BTC8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
MTA3Q9BTC8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
MTA3Q9BTC8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
MTA3Q9BTC8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
MTA3Q9BTC8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
MTA3Q9BTC8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
MTA3Q9BTC8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
MTA3Q9BTC8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
MTA3Q9BTC8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MTA3Q9BTC8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MTA3Q9BTC8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MTA3Q9BTC8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MTA3Q9BTC8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MTA3Q9BTC8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
MTA3Q9BTC8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MTA3Q9BTC8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
MTA3Q9BTC8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MTA3Q9BTC8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MTA3Q9BTC8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
MTA3Q9BTC8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
MTA3Q9BTC8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
MTA3Q9BTC8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MTA3Q9BTC8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MTA3Q9BTC8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MTA3Q9BTC8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
MTA3Q9BTC8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MTA3Q9BTC8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
MTA3Q9BTC8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
MTA3Q9BTC8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MTA3Q9BTC8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MTA3Q9BTC8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MTA3Q9BTC8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
MTA3Q9BTC8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MTA3Q9BTC8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MTA3Q9BTC8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MTA3Q9BTC8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MTA3Q9BTC8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms