Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MTA3Q9BTC8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MTA3Q9BTC8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MTA3Q9BTC8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MTA3Q9BTC8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MTA3Q9BTC8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MTA3Q9BTC8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MTA3Q9BTC8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
MTA3Q9BTC8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
MTA3Q9BTC8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
MTA3Q9BTC8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
MTA3Q9BTC8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
MTA3Q9BTC8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MTA3Q9BTC8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MTA3Q9BTC8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
MTA3Q9BTC8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
MTA3Q9BTC8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MTA3Q9BTC8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MTA3Q9BTC8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MTA3Q9BTC8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MTA3Q9BTC8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MTA3Q9BTC8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MTA3Q9BTC8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MTA3Q9BTC8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MTA3Q9BTC8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MTA3Q9BTC8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MTA3Q9BTC8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
MTA3Q9BTC8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MTA3Q9BTC8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MTA3Q9BTC8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MTA3Q9BTC8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MTA3Q9BTC8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MTA3Q9BTC8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MTA3Q9BTC8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MTA3Q9BTC8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
MTA3Q9BTC8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MTA3Q9BTC8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MTA3Q9BTC8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MTA3Q9BTC8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MTA3Q9BTC8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
MTA3Q9BTC8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MTA3Q9BTC8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MTA3Q9BTC8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MTA3Q9BTC8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MTA3Q9BTC8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MTA3Q9BTC8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MTA3Q9BTC8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MTA3Q9BTC8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MTA3Q9BTC8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
MTA3Q9BTC8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
MTA3Q9BTC8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
MTA3Q9BTC8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
MTA3Q9BTC8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
MTA3Q9BTC8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
MTA3Q9BTC8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MTA3Q9BTC8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MTA3Q9BTC8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
MTA3Q9BTC8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MTA3Q9BTC8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MTA3Q9BTC8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
MTA3Q9BTC8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
MTA3Q9BTC8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
MTA3Q9BTC8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
MTA3Q9BTC8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
MTA3Q9BTC8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
MTA3Q9BTC8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
MTA3Q9BTC8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
MTA3Q9BTC8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
MTA3Q9BTC8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
MTA3Q9BTC8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
MTA3Q9BTC8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
MTA3Q9BTC8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MTA3Q9BTC8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MTA3Q9BTC8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MTA3Q9BTC8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MTA3Q9BTC8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MTA3Q9BTC8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
MTA3Q9BTC8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MTA3Q9BTC8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
MTA3Q9BTC8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MTA3Q9BTC8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MTA3Q9BTC8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
MTA3Q9BTC8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
MTA3Q9BTC8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
MTA3Q9BTC8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MTA3Q9BTC8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MTA3Q9BTC8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MTA3Q9BTC8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
MTA3Q9BTC8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MTA3Q9BTC8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
MTA3Q9BTC8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
MTA3Q9BTC8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MTA3Q9BTC8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MTA3Q9BTC8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MTA3Q9BTC8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
MTA3Q9BTC8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MTA3Q9BTC8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MTA3Q9BTC8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MTA3Q9BTC8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MTA3Q9BTC8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms